朝堂上，君臣们各怀心思，迅速裂变为以陈演、光时亨为首的死守派和以李邦华、李明睿为首的南迁派。两派互不相让，你一句我一句，最后上升到人身攻击。
看到眼前的场景，朱由检真是烦透了。只要大明的官员超过两人在场，就一定会有朋党，有朋党就有党争。以前也就算了，只是关乎自己身家性命的大事，他们也拿来作为党争的筹码，这就让朱由检有些受不了了。他深深地知道，那些反对南迁的臣子，又有几人是真心想保住祖宗的陵寝。他们很多人不过就是爱惜自己的羽毛，有些人甚至纯粹就是因为他同意所以我反对。
朱由检大喝一声：“退朝！”拂袖而去。朝堂内争得面红耳赤的大臣们个个惊得目瞪口呆，整个殿堂瞬间安静了下来。大家面面相觑，鱼贯而出，仿佛经历了一场大战的战士一般潇洒自如。
朝堂上闹得不可开交，日子一天天的拖下去。朱由检可不敢再拖下去了。
李自成在西安建立大顺政权，登基称帝，麾下百万雄兵正浩浩荡荡地杀向北京而来，多尔衮继承了皇太极的遗志，一心想要攻入关内，夺取中原。而此时，明朝在山西和北直隶的守军战斗力极为孱弱，同时因为受到大顺军“三年免征一民不杀”的政治宣传，对明朝廷的忠心程度连连下滑。弄不好，李自成的大顺军不出两月便会抵达北京城下。在东面，除了山海关外，辽东仅剩下宁远孤悬在外，即便它是一颗钉子，也再没实力钉烂满清帝国这张大牛皮，袁崇焕炮轰努尔哈赤的伟大业绩不可能在吴三桂的身上重写。摆在朱由检面前的只有一条路，那就是南下江南，在南京重建朝廷，伺机北伐。
过了几天，李明睿升任翰林院学士。
朱由检向他提出了一连串问题。包括中途接应部队的安排、统领人员、中途驻扎的地点等，李明睿打算先秘密派遣将领至济宁部署接应部队，并在比较安全的济宁、淮安两地安排驻地。朱由检又问接应部队从哪里调集，李明睿承认，所有明军主力不是用于镇守关口，抵御义军，就是在边地抗击清军。京城关门兵也不能全部抽出，因为必须留下部分军队护卫留守北京的官员。所以只能暗中派遣一些朝中官员从京畿八府征募新兵。
从这里可以看出崇祯帝是想要南迁，因为江南形势和条件比久经战乱的北方要好，而且在当时的江北各地尚有刘良佐、刘泽清、黄得功、左良玉、高杰五位总兵驻守，显然比北京安全。除了少数几个之外，大多数大臣竟然没有一个人给崇祯台阶下，完全不支持崇祯南迁的想法。
强敌一步步压镜，朱由检真的不敢再等下去了。他把李邦华、吕大器和李明睿等结果主张南迁的大臣们留了下来，吩咐道：“朕已决意南迁，现在只有这一条路可以走。你们不要伸张出去，秘密准备。朕估计，流贼最多再有两个月就会迫近京师，所以你们一定要快。要快！”
李明睿等人明确表示：愿为陛下赴汤蹈火，全力保证南迁的安全。
为了提升沿途的安全系数，朱由检下诏封刘良佐为广昌伯、刘泽清为东平伯、黄得功为靖南伯、左良玉为宁南伯、高杰为兴平伯，意图以高官厚爵笼络他们。朱由检也不忘辽东前线，专门下诏封吴三桂为平西伯。
尽管朱由检一再要求南迁准备秘密进行，但没有不透风的墙，消息还是走漏了，而且流到了光时亨等人的耳中。
光时亨立即觐见朱由检，声称李明睿主张南迁是歪理邪说，不杀李明睿，天理难容。
朱由检心里一面暗自骂着李明睿的不小心，一面对南迁之事又生疑窦。他不得不叫王承恩把李明睿宣进殿中，与光时亨对峙。
李明睿本以为皇帝召见是询问南迁准备情况的，可是一进宫门，看见朱由检拉着一张脸，旁边还站着光时亨，心里顿时明白了：这是又生出了变故。
还未等李明睿说话，朱由检就开口说：“李明睿，你跟光时亨说，怎么叫个准备南迁了。”
李明睿深知此刻绝不能将南迁之事透露出去，至少不能表现得让它跟皇帝扯上关系。他想了想，对光时亨说：“前些日子我主张陛下南下，光大人认为祖宗陵寝不可丢弃，坚决要求陛下死守京城。这几日，我思来想去，陛下可以死守京城，但太子和诸位皇子皇女可南下到南京去，在那里搭起朝廷的班子。一旦北京战事不利，陛下率众南下也有个落脚之处。如果京城战事顺利，流贼可破，则战后太子几个再回来就是了。”
光时亨冷笑道：“你这诡谲伎俩，也想哄得过我吗？”
一场暴风骤雨似乎又要来临。