东汉建立后，在行政区划工作上做了两件大事，一是恢复西汉时的郡县名，清除王莽新朝时乱改的地名，重新规划全国的郡县，撤并了西汉时的县、道、邑、侯国400多个，王莽时增置的郡县基本上全部撤销，郡国数量相应减少。二是在州的建制上做了较大的变动，刘秀全部废除王莽所建的十二州牧，改交陟（去步加止，趾）为交州，恢复西汉的部州，并固定其州治驻所。升大州级的权力。至东汉末期，体制基本上实行州、郡、县三级。
东汉顺帝永和五年（140年），其疆域区划为司隶校尉部，十二州刺史部和西域长史府，各王国、属国按郡制；邑、道、侯国、公国等按县制。具体区划如下：
司隶校尉部
京兆尹治长安（今陕西长安三桥）。
领10县：长安、长陵、阳唆、霸陵、杜陵、新丰、蓝田、郑县、上雒、商县。
右扶风治槐里（今陕西兴平）。
领15县：槐里、茂陵、平陵、鄠县、武功、美阳、郿县、雍县、杜阳、陈仓、渝麇、汧县、漆县、栒邑、安陵。
左冯翎治高陵（今陕西高陵）。
领13县：高陵、池阳、万年、重泉、临晋、颌阳、夏阳、频阳、粟邑、衙县、没（去三点水加示部旁）栩、云阳。
河东郡治安邑（今山西夏县禹王）。
领19县：安邑、闻喜、猗氏、大阳、河北、蒲坂、汾阴、皮氏、绛邑、临汾、襄陵、杨县、平阳、永安、北屈、蒲子、端氏、蠖（去虫加三点水）泽、东垣。
弘农郡治弘农（今河南灵宝北黄河南岸）。
领9县：弘农、陕县、湖县、华阴、卢氏、黾池、新安、宜阳、陆浑。
河南尹治雒阳（今河南洛阳东北）。
领21县：雒阳、平县、平阴、谷城、河南、新城、梁县、偃师、缑氏、巩县、成皋、荥阳、卷县、原武、阳武、中牟、开封、苑陵、新郑、密县、京县。
河内郡治怀县（今河南武陟西南大虹桥南）。
领18县：怀县、武德、平皋、州县、温县、河阳、野王、波县、轵县、沁水、山阳、修武、获嘉、汲县、共县、朝歌、荡阴、林虑。
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豫州刺史部
颍川郡治阳翟（今河南禹州）。
领17县：阳翟、阳城、轮氏、郏县、父城、颍阳、襄城、昆阳、舞阳、定陵、郾县、临颍、颍阴、许县、新汲、鄢陵、长社。
汝南郡治平舆（今河南汝南射桥）。
领37县：平舆、上蔡、灈阳、吴房、西平、定颍、召陵、洇（去因加隐）强、西华、征羌、汝阳、南顿、阳安、郎陵、北宜春、安城、慎阳、安阳、新息、弋阳、期思、原鹿、富波、褒信、新蔡、鲖阳、固始、项县、宜禄、新阳、宋国、思善、城父、山桑、细阳、汝阴、慎县。
陈国治陈县（今河南淮阳）。
领9县：陈县、新平、宁平、武平、苦县、柘县、阳夏、扶乐、长平。
梁国治睢阳（今河南商丘县城）。
领8县，睢阳、蒙县、宁陵、鄢县、谷熟、虞县、下邑、砀县。
沛国治相县（今安徽濉溪张集）。
领21县：相县、肖县、杼秋、丰县、沛县、临睢，太丘、建平、鄼县、谯县、郸县、锧（去质加至）县、竹邑、蕲县、符离、谷阳、洨县、虹县、向县、龙亢、公丘。
鲁国治鲁县（今山东曲阜）。
领6县：鲁县、汶阳、卞县、驺县、蕃县、薛县。
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兖州刺史部
陈留郡治陈留（今河南开封县陈留）。
领17县：陈留、雍丘、尉氏、扶沟、圉县、襄邑、己吾、考城、外黄、济阴、东昏、小黄、浚仪、封丘、平丘、长垣、酸枣。
东郡治濮阳（今河南濮阳庆祖北）。
领15县：濮阳、白马、燕县、顿丘、卫国、东武阳、阳平、东阿、范县、谷城、临邑、乐平、发平、聊城、博平。
济阴郡治定陶（今山东定陶城西北）。
领11县；定陶、冤句、乘氏、句阳、成阳、鄄城、廪丘、离狐、成武、单父、己氏。
山阳郡治昌邑（今山东巨野昌邑）。
领10县：昌邑、巨野、金乡、东缗、防东、方与、高平、湖陆、南平阳、瑕丘。
任城国治任城（今山东微山鲁桥）。
领3县：任城、亢父、樊县。
东平国治无盐（今山东东平宿城）。
领5县：无盐、寿张、须昌、富城、章县、东于陆、宁阳。
济北国治卢县（今山东长清马上附近）。
领5县：卢县、茌平、蛇丘、刚县、成县。
泰山郡治奉高（今山东泰安范镇）。
领12县：奉高、博县、梁甫、巨平、茌县、嬴县、牟县、莱芜、盖县、南武阳、费国、南城。
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青州刺史部
平原郡治平原（今山东平原饮马店附近）。
领10县：平原、高唐、祝阿、漯阴、安德、鬲国、西平昌、般县、乐陵、厌次。
济南国治东平陵（今山东章丘枣园西北）。
领1。县；东平陵、土鼓、历城、台县，著县、菅县、东朝、邹平、梁邹、于陵。
乐安国治临济（今山东高青高城镇）。
领9县：临济、高苑、千乘、乐安、博昌、利县、寥城、寿光、益县。
齐国治临菑（今山东淄博临淄区齐都）。
领6县：临菑、西安、昌国、般阳、广县、临朐。
北海国治剧县（今山东昌乐尧沟镇）。
领18县：剧县、东安平、平寿、营陵、朱虚、安丘、昌安、平安、高密、夷安、淳于、都昌、下密、胶东、即墨、壮武、挺县、观阳。
东莱郡治黄县（今山东龙口黄城集）。
领12县：黄县、嵫（去山加巾）国、曲城、掖国、当利、卢乡、牟平、东牟、昌阳、长广、不其、黔陬。
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徐州刺史部
琅邪国治开阳（今山东临沂北戴城子）。
领13县，莒县、东安、东莞、姑幕、诸县、东武、琅邪、沟曲、阳都、临沂、开阳、即丘、缯国。
东海郡治郯县（今山东郯城城北）。
领13县：郯县、襄贲、兰陵、丞县、阴平、戚县、昌虑、合乡、祝其、利城、赣榆、朐县、厚丘。
彭城国治彭城（今江苏徐州）。
领8县：彭城、留县、广戚、傅阳、武原、吕县、梧县、甾丘。
下邳国治下邳（今江苏邳县古邳）。
领16县：下邳、良成、司吾、下相、取虑、僮国、夏丘、徐县、睢陵、盱眙、高山、淮陵、东城、曲阳、淮浦、淮阴。
广陵郡治广陵（今江苏扬州城北）。
领12县：广陵、江都、舆国、堂邑、海陵、高邮、平安、东阳、淩县、射阳、诲西、盐渎。
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冀州刺史部
魏郡治邺县（今河北临漳邺镇）。
领15县：邺县、内黄、黎阳、繁阳、阴安、魏县、元城、馆陶、清渊、平思、斥丘、曲梁、梁期、武安、涉国。
清河国治甘陵（今山东临清东北）。
领7县：甘陵、贝丘、灵县、郁（去有加俞）县、绎幕、广川、东武城。
安平国治信都（今河北冀县）。
领13县：信都、扶柳、堂阳、南宫、陉县、武邑、观津、下博、武遂、饶阳、安平、南深泽、阜城。
巨鹿郡治廮陶（今河北宁晋东陈附近）。
领15县：廮陶、杨氏、郧（去员加枭）县、下曲阳、南辔（去口去车加言）、任县、平乡、南和、巨鹿、广干、曲周、广宗、广年、斥章、列人。
赵国治邯郸（今河北邯郸）。
领5县：邯郸、易阳、襄国、中丘、柏人。
常山国治元氏（今河北元氏殷村）。
领12县：元氏、栾城、平棘、高邑、房子、上艾、真定、九门、蒲吾、井陉、灵寿、南行唐。
中山国治卢奴（今河北定州）。
领13县：卢奴、安熹、汉昌、蠡吾、安国、毋极、新市、上曲阳、望都、唐县、蒲阴、北平、广昌。
河间国治乐成（今河北泊头千户屯附近）。
领11县；乐成、弓高、成平、中水、武垣、束州、东平舒、高阳、鄚县、文安、易县。
渤海郡治南皮（今河北南皮常庄）。
领8县：南皮、东光、重合、高城、阳信、修县、浮阳、章武。
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荆州刺史部
南阳郡治宛县（今河南南阳）。
领36县：宛县、西鄂、博望、堵阳、雉县、叶县、犨县、鲁阳、郦国、析县、丹水、南乡、顺阳、武当、冠军、鄼县、阴县、筑阳、山都、邓县、蔡阳、章陵、襄乡、湖阳、朝阳、新野、安众、穰县、涅阳、棘阳、育阳、舞阴、比阳、平氏、复阳、随县。
江夏郡治西陵（今湖北新洲城河西岸）。
领14县：西陵、邾县、鄂县、蕲春、下雉、沙羡，安陆、南新市、云杜、竟陵、西阳、软（去欠加大）国、郡（去君加黾）县、平春。
南郡治江陵（今湖北江陵）。
领17县：江陵、华容、州陵、枝江、夷道、夷陵、当阳、鄀国、编县、宜城、却（去去加己）国、中卢、襄阳、临沮、秭归、巫县、佷山。
长沙郡治临湘（今湖南长沙）。
领12县：临湘、湘南、益阳，罗县、下隽、连道、昭陵、醴陵、安城、茶陵、攸县、容陵。
武陵郡治临沅（今湖南常德）。
领12县：临沅、沅南、汉寿、作唐、孱陵、零阳、充县、酉阳、迁陵、沅陵、辰阳、镡成。
零陵郡治泉陵（今湖南永州）。
领13县：泉陵、营浦、营道、泠道、重安、湘乡、昭阳、燕阳、夫夷、都梁、洮阳、零陵、始安。
桂阳郡治郴县（今湖南郴州）。
领11县：郴县、汉宁、便县、耒阳、阴山、临武、南平、桂阳、曲江、浈阳、含洭。
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扬州刺史部
九江郡治阴陵（今安徽凤阳周圩西南）。
领14县：阴陵、西曲阳，寿春，当徐、下蔡、平阿、义成、钟离、成德、合肥、浚遒、全椒、阜陵、历阳。
庐江郡治舒县（今安徽庐江桂元西）。
领14县：舒县、临湖、襄安、居巢、皖县、寻阳、龙舒、六安、安丰、潜（去日加鬲）县、雩娄、阳泉、寥县。
丹阳郡治宛陵（今安徽宣州）。
领16县：宛陵、芜湖、春谷、溧阳、丹阳、石城、秣陵、湖熟、江乘、句容、故鄣、于潜、泾县、陵阳、黟县、歙县。
吴郡治吴县（今江苏苏州）。
领13县：吴县、娄县、无锡、毗陵、曲阿、丹徒、阳羡、乌程、由拳、海盐、余杭、钱唐、富春。
会稽郡治山阴（今浙江绍兴）。