朝廷于是授命秦良玉为都督佥事、充都督同知总兵，并加封为夫人，授马祥麟为宣慰使，秦民屏为副总兵，秦翼明、秦拱明为参将。
授官后，秦良玉又收复红崖墩、观音寺、青山墩等贼军重要据点，奢崇明兵败自杀, 秦良玉彻底平定奢崇明四川之乱。
朝廷因功多次赏赐秦良玉金币。
天启三年，秦良玉上书说：“我带着秦翼明、秦拱明裹粮出战，先后取得了像红崖墩三战那样的胜利。”
“可是那些离间我们君臣的大将们，他们没见过贼兵的面，却在那里整天挥着胳膊吹嘘，等到和贼兵对垒时，就闻风而逃。”
“那些自己被贼兵打败了的人就担心别人战胜贼兵；自己被贼兵吓住了的人就怕别人胆子比贼兵大。”
“像总兵李维新，他在渡河一战中失败回营，反而拒我于门外, 不容我进城相见。以一个六尺身躯的大男子忌妒一个巾帼妇人，他如果夜静时想一想就应当羞死。”
皇帝朱由校于是下诏文武大臣必须以礼招待秦良玉，不得有任何猜忌。
天启四年，秦民屏随巡抚王三善率军在陆广作战失败，王三善率先逃走。
秦民屏在大方大破贼兵，屡战屡胜。退兵时，遭到贼兵袭击，奋战而死，秦民屏两个儿子秦佐明、秦祚明突围而出但也重伤。
秦良玉上书请求抚恤，朝廷于是追赠秦民屏为都督同知，并立祠祭祀，两个儿子秦翼明、秦拱明封参将。
从秦良玉的这些事迹来看，秦良玉确实是朱由校调兵进京的最好一个选择。
因为秦良玉对朝廷可以说的上是忠心耿耿，对天启皇帝也足够忠心。
而朱由校在过去的几年时间里，多次对马家以及秦良玉进行封赏，无论外人怎么想, 但单从秦良玉和马家人的心目中来看，这朱由校来起码也是一个明君了。
在历史上, 这秦良玉也无论是在对抗各地纷乱而起的乱军，还是对抗建奴的入侵，都产生了极大的作用。
尤其是历史上在对付建奴入侵时，秦良玉所率领的白杆兵与建奴白甲兵正面野战，竟然完全不输于建奴的白甲兵。
甚至如果后来不是建奴调来的大炮，轰击白杆兵的阵地，那么他们基本上不太可能击败百杆兵的阵地。
这也是朱由校之所以将秦良玉调进京的原因，足够忠心并且麾下军队的作战能力又足够强大。
现在他的那些火枪兵训练的已经差不多了，如果说让他们把他们拉到战场上，跟建奴的军队野战对面打打火枪，那倒还可以。
但是如果让他们真枪白刃的跟建奴的白甲兵厮杀，那差的还是太远了。
并不是说他们的勇气不够，实在是他们的经验与阵型等等，与白甲兵相差得还是颇远的。
这些是需要用时间和大量的赏赐来熬的，不是说朱由校这些训练了七八个月就能够快速练成了。
秦良玉收到这种书信之后，赶紧把自己的两个外?秦佐明、秦祚明找了过来，再把朱由校亲笔写的书信交给两个外?看。
只见两个外?秦佐明、秦祚明看完里面的内容之后, 也大为震惊。
“陛下这字是真丑啊！”