之前福建第一师和泉州本地的防卫军合起来有六个团，都是一些参差不齐的小团。这六个团整编为三个团之后，必然会少三个团长的职位。何福光直接说明这裁掉的三个团长全部划归师部军官，也算是一种升职安抚。
福建整编第二师的整顿工作就在泉州展开，参谋总部和三十九师派遣教练官协助训导和规划。从十月十五日开始，预期一半个月之内完成所有建制。在目前统计的情况下，整编结束之后仍然会有不少中下级军官空缺，这些空缺的名额会从粤军教导团、黄埔军校分配人员来接替。所有团部级以上军官名单会尽快公布，何福光承诺尽量原职原人。
除此之外，何福光还规定整编第二师正式落成之后，后勤部由参谋总部后勤处直辖，全师上下的一切供应和军饷都与粤军保持一致，绝不会有任何偏袒。既然是由广东军政府出资养兵，福建军队同样也要遵守广东军队的规章制度。参谋总部会尽快制订派遣顾问军官团规范风纪的计划以及进驻福建各军的宪兵队计划。
对于这些要求，闽军军官虽然有些担心，毕竟他们的习惯跟粤军有很大的出入，不知道能否适应。但是他们心中都很清楚，既然从此以后吃人家的、用人家的、穿人家的，当然要听人家的指挥。在担忧之外也有让他们感到欣慰的地方，那就是物资供应上与粤军一致，这可意味着日后自己也能享受到特供茶、特供烟等等的待遇。
不少有骨气的闽军军官在心里鼓起一股劲儿，粤军能做到，凭什么闽军不能做到？粤军军官可以不贪污军饷、不吃空额、军纪严明，凭什么闽军军官不能如此？他们下定决心，一定不能让粤军看扁，甚至还要做得比他们更好。
“何大人，为啥我们第一师要改叫第二师啊？那整编过后第一师是哪一路？”这时，一名福建第一师参谋官疑惑不解的问道。
“新福建第一师的番号会由漳州师来接替，这不是任人唯亲的决定，毕竟漳州师的建制要提前完成。再者，第一师、第二师只不过是番号序列，可没有第一师拿的军饷比第二师多的说法。你们真要争一个第一，那就在战功和军纪上争第一。正如我们广东第一骑兵师辖下的第十一光荣骑兵团，假设你们第二师在各个方面都发挥了优良作风，迟早都能赢的比番号序列更响亮的荣誉称号。”何福光掷地有声的说道。
在这个问题上闽军众人并没有太多闲言碎语，番号只不过是一个称呼罢了，反正只要后勤保障没有差别大家都能很轻易的接受。
会议到傍晚结束，何福光决定了整编泉州部队的大框架，至于细节问题则交给各级长官、参谋官负责落实。当晚七点，他带领参谋总部的军官小组又动身前往莆田，由于莆田尚且不在粤军部队的掌握之中，为了安全起见三十九师调动麾下第八团随同前往，同时闽军第一师也派出两名师部军官陪行，方便安抚暂编第二师。
半夜时第八团前锋部队先一步抵达莆田，因为天黑不识路，暂时没有进城。
到第二天天亮之后，何福光带领后续部队赶到，众人一起开进城去。
暂编第二师早就收到福州发来的电报，也得知了泉州的情况，深知大势已去。论起战斗力和装备情况，暂编第二师的战斗力比第一师相差甚远，麾下三个团全部是预备役部队抽调而成，全员加在一起才勉强四千多人，大部分武器都是旧式步枪，其中还有不少因为长期欠缺保养而损坏。
面对刚刚收编泉州第一师的粤军劲旅，暂编第二师师长几乎没有任何选择余地，只能命令麾下部队在营中待命，等待接受改编的命运。对于那些不服气的部将，不等粤军进城处理，他已经先一步绑了起来。
何福光进城之后，与暂编第二师师长见了一面，对第二师明智的选择表示欣慰。
之后就在第二师的司令部内，召开了关于莆田各路闽军的整编会议。
在莆田的闽军驻部除了暂编第二师之外，仍然还有几支零散的旧营部队，合计起来差不多有一千多人。何福光早在整编泉州军务之际就已经拟好莆田的整顿计划，他决定将福建暂编第二师和本地其他驻军合编为福建整编第三师，编制与整编第二师一样，辖下三个满编大团，配全师部直辖部队。
莆田方面兵力不足，可以从同安、厦门、龙岩等地抽调之前的闽军降部。