国防部命令顾品珍于十一月之前调回云南，撤销湘北军务总督之职，改任云南军务总督；王文华也奉命率部返回贵州，出任贵州军务总督。顾品珍所率领的滇军军团与王文华的黔军军团合编为南方第二集团军，两省共编制五个精英师的常规部队，除了集团军配置之内的战斗序列，其余地方部队全部裁撤。
南方第二集团军五个师番号顺延中央第三集团军序列，为精英第二十、第二十一、第二十二、第二十三、第二十四和第二十五师。顾品珍为总司令，王文华为参谋长，司令部设于昭通。该军团主要负责藏康越边境以及西南部分沿海的防务。
吴绍霆在整编序列的命令之后还附加一项密令，要求顾品珍在整编结束之后，着手加强本部人马的训练，随时执行入藏收复被英军侵占国土的军事行动。
至于四川地区，吴绍霆与国防部协商之后，决定不设集团军编制，仅仅将川军四个师整编为两个精英师番号，隶属于四川司令部直辖，熊克武为第二十六师师长、刘存厚为第二十七师师长。
最后，吴绍霆还特意与蔡锷、冯国璋等人经过讨论，决定将之前准备北伐蒙古平定叛乱的几个北洋中央师整编为北方第二集团军。这是《全**事整编计划定案》中第一阶段整编的最后一个集团军番号。虽然兵力、驻地都是现成的，可是却没有合适的负责人选，只能由国防部直接负责所有编练工作。
当然，吴绍霆心中仍然是有自己的打算，历史上收复外蒙古是徐树铮所为，如今徐树铮尚且在精英团第一期学习，而且国内战事刚刚结束，自己的用心则放在东北方向，因此西北的事务还得容后一段时间。等到徐树铮从精英团毕业之后，他会安排这位国战名将调任北方第二集团军，筹划北伐外蒙古的作战。
北方第二集团军辖下精英第二十八师、第二十九师以及第三十师三个番号，额外再配备新三十一师、新三十二师两个空番号，又北京大本营新兵司令部负责招募训练。国防部预备派出总参谋长何福光，连同中央第三集团军总参谋长韦汝聰二人携带幕僚组北上，全权负责北方第二集团军的组建工作。
以上七个集团军的番号是第一阶段全**事整编的主要内容，也是共和国精英师目前全部的编制单位。国防部曾经打算为共和国精英师设计制式军服，并且优先筹集款项将军服推广到所有精英师之中，不过吴绍霆认为共和国精英师相当于中国目前的主战部队，涉及的防御地区地理环境各有不同，军装应该因地制宜才是。
不过共和国精英师仍然拥有独立的徽记，为了体现共和国精英师的无畏精神，并且给所有敌人留下深刻印象，吴绍霆不惧众议，毅然决定采用黑色骷髅头为主要图案，“志诚”式轻机枪和“绍霆”式自动步枪交叉在其后。
做为蔡锷寄托国防宏源以及中华民国最终军事体系的国防军，在十月中旬完成了第一期新兵特训，不过与其称呼这些国防军士兵是新兵，还不如说是老兵新练。在整个第一期训练当中，各地特训营合计招募的纯新兵数量不足四千人，从九月份开始各地特训营大部分招募的兵源都来自现役部队。
尽管之前国防部是严格规定要特训营是四个月训练，可这个法则仅仅是针对纯新兵，当现役部队兵员进入特训营之后，几乎只用了半个月的时间就通过了所有军事基础考核，余下的一个月时间全部用来补习文化和思想教育。这些兵员都是从各现役部队精挑细选出来的，本身就具备十分良好的军事和文化底子，再加上特训的强化，不可不谓是精锐中的精锐。
第一期特训新兵的总人数超过一万六千人，而第一期结束之后，更大规模的国防军招募紧接着展开，并且在武汉、北京、南京、兰州四处增设了新的特训营。无论是共和国卫队还是共和国精英师，但凡通过报名考核者，都会由中央预备役司令部分派到各个特训营受训。从第二期开始，各地特训营采取交叉训练的方式，南方士兵去北方，北方士兵来南方。
如今国防军的兵力只够编成一个师，番号暂定为国防第一师。由孙继直出任师长，并破格提拔何应钦为副师长兼代理参谋长，特聘国防大学外教鲁登道夫为军事顾问。
目前各地新兵营特训营的国防军士兵都奉命前往广州集合，不过这次会议结束之后，第一师将会调驻至江苏扬州。
参加这次大会的所有人都知道，之前七个集团军番号当中唯独没有提及中央第一集团军，可见吴绍霆是特意打算将这个番号留给国防军。这正是吴绍霆的打算，在第二期国防军特训结束之后，如果不出差错，国防军兵力足以完成集团军建制——