从天正十二年的11月12日开始起，明智小五郎开始暂时管理柴田家族以及关东三国的一切军政要务。
为了更好地稳定柴田家，明智小五郎极力拉拢佐久间盛政和金森长近，倚为左膀右臂，并不断肃清家中的不臣之人。
后人对明智先生这段时间的管理给予了很高的评价：
说这话的人，乃是数百年后的明治天皇，他巡幸长野，群马，甲府，山梨四县的时候，有感而发。
实际上，明智小五郎治理关东三国，不过一个多月，要说起实际成效，在短短的一个多月里，是根本体现不出来的。唯一可以作为参照的是，他在上野的时候，关东三国还算是秩序井然，家臣尚且还能各司其职，北条氏也不敢犯边。等他一离开，上野的秩序马上就开始乱起来了。因此可见，在特殊时期，集团如果没有一个合适的核心，那么崩坏的几率是相当恐怖的。
还有就是，明治天皇希望借此安抚在里，势力最大的明智氏。
不同于萨摩藩和安艺藩均被维新志士掌控，长州藩完全是藩主和高级家臣控制。因为在之前，便常年和外国人进行走私贸易，财力军力均强过岛津家族与毛利家族一筹。最令天皇不安的是，维新思想和维新势力，在长州藩内，都不是主流，之所以愿意参加倒幕战争，只不过是因为想趁机扩大势力而已。
在戊辰战争中，长州藩单独出兵近四万，比萨艺两藩加起来都多。而之后的新政府军中，从长州藩里面走出来的军官，也有近万人。而在新政府各层机关中，长州藩士占据着机要部门，最令天皇陛下如骨梗喉的是，新的责任内阁虽然成立了，但是公卿出身的三条实美，在首相的位子上，还没有干满三个月，就被明智慕光提名的长州藩士伊藤博文给挤下去了，真是气煞人也！
不仅如此，明智慕光还和岛津忠义以及毛利元德来往密切，相互倚重，共进共推。三个被封为公爵的华族，被人戏称为，实际上已经完全操控了日本的国政，即便是明治天皇自己，也不过是个有名无实的而已。
既然是人家做主，自己说话，当然要看人家脸色了，天皇也不过如此啊！
。。。。。。
斋藤光透一边说一边扫视着周围诸人。
满头大汗的忍者荒井大藏问道：
斋藤光透轻声摇头道，
大藏好像明白过来，猛地用扇子拍了拍马屁股。
斋藤光透颇有兴致，道：
他再也控制不住，放声大笑。
对于在前桥城里受了这么久的苦的斋藤光透来说，这一切如在梦中。他根本没有想到，这十几天以来，日思夜想的钵形城，居然因为一群忍者的出现，而轻易回归了。