山南城被屠之后，山南府所辖各县均被明军暴行震住，当地官员纷纷派兵约束境内，不许对汉人进行仇杀，同时士绅商人花重金请汉人出面前往明军处说和，仿宝州例以赎城费用换取县境安宁。对此，明军欣然笑纳，除钱粮以外，另要安南地方各县提供500至1000不等的青壮劳力以供大明雇佣。
雇佣时间为三年，届时结算工钱使人回乡，大明保证雇佣之安南工人人身安全。同时，明军还提出条件，鉴于前阵安南大规模屠戮汉人无辜百姓，为防此事再次发生，当地汉人聚居处当成立保安队，择汉人青壮授以武器以求自保之力。汉人保安队之钱粮供应开支，当由安南地方负责，以示惩戒。
若单是给钱给粮便罢了，明军还要人，更过份的还要武装治下汉人，这条件不是丧权辱国、埋下大祸是什么。
山南各县安南官员也不是傻子，当然知道明军没安好心。所以9个派人来洽谈的县只有3个捏着鼻子同意了明军要求，其余要么是怒声指责，要么是不置一言。结果短短数天之内，明军又打破两城，尽如山南府城例被屠戮一空。于是，苦等中央援军未果，自身又无力保家卫国的安南地方官员们纷纷再次派人携带大量酒食前往明军驻地犒军，随后，便各自签下条约。这些条约被明军统称为地字约，即非郑氏中央所签条约，不具备法理性，但大明讲究礼信，为免两民再有伤亡，对签署地字约的安南地方一视同仁。
在山南各县安南地方官员的“配合”下，安南人民大规模反抗侵略军的壮举被镇压，无数青壮男丁在家人的哭泣下被安南官兵用绳子捆绑送往明军营地。山南境内的汉人因为明军的支持，也纷纷组建保安队，一方面自保，另一方面却又配合明军和安南官军镇压境内安南人的反抗力量。
山南境内还未彻底平定时，牛根生又率部进犯清化。因南方河静屠汉风潮越演越烈，已经波及到北方诸府，安南汉人为求自保，纷纷组织起来反抗安南官府，约请明军相助。仅河静一地，便有两万多汉人聚众结社，乞求明军给予军械帮助。清化府，有汉人庞炳德拉众数千攻陷县城，响应明军。
对于各地汉人反抗力量，赵自强传下命令，各部必须无条件支持援助，若愿意归纳，即加以改编为太平军，不愿归纳者，发给缴获安南军械，使其有自保之力，替明军扫荡剿灭占领区内大小安南反抗组织。而对愿意花钱消灾的安南地方，则效仿山南例处置。
七月初四，第十二镇攻陷清化平湖城，发起清化之战。安南郑氏清化镇守官李化成战死，在明军屠城威逼下，清化统领郑德开城投降，至此，山南、清化两镇首府均为明军占领，升龙府同南方联络被明军切断。此后，水师郑成魁部又入锦罗江，以战船43艘，水兵3000、陆军600及安南汉人反抗军4000余溯江上犯，准备切断安南内陆交通大动脉湄公河。7月9日，明军发起德庆之战，遭安南郑军顽强抗击，被击毙击伤169人后攻陷德庆。
北路周胜部在得到海阳水寨增援的1000水兵和第十一镇紧急调去的600陆军后，开始向广宁进军。明军将大量舰炮拆下带到岸上，凭借强大的火力一下便突破广宁郑军防线，军心士气大涨，气焰十分嚣张，叫嚣“先下广宁，后下太原，直取升龙！”
广宁境内汉人虽然没有遭到郑军屠戮，但也纷纷起来效仿南方，或组织武装力量反抗安南官府，或投奔明军，或充为向导，或提供钱粮。