但曾国藩的弹压十分辛苦，因为大多数湘军士兵，本来就是为了能够攻占天京劫掠的目的，才维持军纪的，现在天京拱手让明军占了，他们能没有怨言吗，所以劫掠百姓，跟明军冲突。
可明军不是好惹的，敢于挑衅的湘军大都没什么好下场，甚至出现成建制的湘军，被明军歼灭的情况，因此江南此时不但没有恢复平静，反而变得更加的混乱。
曾国藩的压制，没有起到太大的效果，而是让大量的湘军逃亡落草为寇。历史上，曾国藩在攻入天京后，就地解散湘军，就出现了大批士兵不回乡，而是落草为寇的情况，荼毒了江南之后十多年。
此时列强的态度则很不一致，法国因为跟大明的关系变好，对此没有任何表示，英国人对此表达关切，可显然已经不愿意插手了，他们惟愿江南秩序尽快恢复，也让英国在这一地区的利益尽快恢复。
为了防止夜长梦多，大明租用了在救灾时期建立起来的庞大的民间船队，用上万艘大小不一的各种船舶，先将太平军转移到了福健沿海岛屿金门岛上安置，然后在这里进行登基，分类之后，在送到不同的地方去。
能够生产民用手工艺品的工匠，送到大明的城市里就地安置，只有瓦工等普通技艺的，则送去太平洋的垦殖地去安置，那里各种手工匠人，否则连基本的生活用品都无法自足，全靠国内供给的话运输成本太大，这也是为什么这块殖民地持续亏损的原因。
那些完全没有一技之长的，才会送到阿拉斯加去。
但所有这些都不包括各个级别的王爷，但这些王爷有自己的选择，汪海洋选择留在福建，杨辅清则选择回家，至于李秀成，出人意料的决定跟他的部下一起去海外。
江南问题拖延了大半年，当天京城所有太平军和家属以及百姓都转移走之后，大明跟清廷进行了领土交换，开始逐步从江南撤走明军，并且从广西向云南开进队。
江南问题基本上就这样结束了，尽管有波折，但结果还算圆满，主要是满清，上下都送了一口气，横亘在他们喉咙中的那根刺终于拔除，许多从头到尾经历了太平天国运动的清廷官员，甚至有一种不敢相信就这样结束了的感觉，八旗子弟们也觉得脸上有光，酒楼、茶馆里成天吹牛，大言蔑视太平天国不过跳梁小丑这天下说到底是大清的，而他们完全将在太平天国运动期间成立的大明国当作空气忽略不谈，同样不谈的，还有镇压太平军的第一功臣，曾国藩。
曾国藩此时也面对一个问题，那就是如何处置湘军的问题，湘军在编制上始终不是正规军，而是乡勇，军制上是应该随着军事行动的结束而裁撤的，可是裁撤了湘军，留那只队保卫大清呢。
所以曾国藩两难，不裁撤湘军，层出不穷的军民冲突，已经让他难以忍受了，裁撤湘军，那么近在咫尺的大明，谁来防备。
此时的大明，却已经将目光暂时从江南转移走了，他们的目光看向了东方，就在今年，日本人将琉球王室掳到了东京，将琉球国彻底灭亡了。
大明对此的态度是，绝对不能接受。。