斟酌了一下，方从哲向皇上提议，“陛下，国初设置奴儿干都司时，是从海上运粮。()为此，才把奴儿干的首府，设在了奴儿干城……”
朱由校点点头，这奴儿干城在黑龙江下游入海口附近，而它东边不远，就是大名鼎鼎的库页岛。而从兵部的档案上看，联系奴儿干城和内地的路线，除了海路，便是沿海的一系列卫所了。至于其他的广大地区，虽也有卫所设置，却只是在名义上管辖。
不过，那都是永乐年间的事了。自宣德九年后，奴儿干都司被撤销。而到了努尔哈赤兴起后，这些卫所被阻断进京道路，便和朝廷失去联络。
朱由校虽想恢复奴儿干都司，以从侧面包抄蒙古，却不愿花费太多的财力、物力。而这，也是内阁同意恢复奴儿干都司的先决条件……
“既然能够海运，那就海运吧。”朱由校很快便作出了决定，“可奴儿干都指挥使，还是要负责屯田，以满足本地之需。”
“陛下，”见皇上没有明白自己的意思，方从哲只好把话挑明了，“奴儿干地处偏远，本是苦寒之地，有奴儿干都指挥使带着卫所兵丁驻守，也就够了。至于新军将士，都是虎狼之师，还请陛下留作他用吧。”
按照明朝制度，卫所在驻防的同时，还要屯田，以满足自己所需。而朱由校一手建立的新军，却是完全靠朝廷供养，方从哲不愿新军驻防奴儿干，正是出于财政的考虑。
“方爱卿还是不明白朕的意思啊，”朱由校直摇头，“朕以为，奴儿干想要长治久安，必定要大幅度移民。而百姓畏惧奴儿干苦寒，必定不愿前去。为此，只有借助军屯，向奴儿干移民。
可按照以往的军屯来看，将士们在种过几年地之后，便再也拿不起刀枪。这样一来，我大明在奴儿干的军队便不复存在。
而新军不同，新军都是职业兵，他们不需要去种地。这样就可以保留一支军队在奴儿干，震慑各土司。等军屯见到成效以后，就可以逐步的供养起新军，巩固边防。”
方从哲低头想了半晌，才抬头问道：“按照陛下的想法，那就是军屯只做种地用？”
“对，”朱由校点点头，“指挥使负责组织屯田，巡抚负责收税，收税之后的所得，都归屯田兵卒所有。等时间长了，那些军卒能立住脚了，便免去他们的军籍，改设州县。”
方从哲沉吟不语，孙如游却穴话道：“陛下，而是如此，内地的卫所必定不满。”
按照明朝的制度，内地的卫所都担负着屯田任务。即便是所屯军田被士绅、军将侵占，那些士兵也不能免除军籍，日子过得极其悲惨。这在以往并无不妥，可如果让奴儿干的军户可以转为民户，必定会让内地军户产生比较之心，引起混乱。
朱由校想了想，解释道：“奴儿干和内地相隔甚远，想必不会影响太大。至于辽东，改为行省后，军户制度也会发生改变，也不会受多大影响……”
方从哲又奏道：“陛下既有圣断，臣自当奉命。只是奴儿干的官佐，还需陛下ti谅一二。”
朱由校会意，想了想，作出了决定，“奴儿干地区，以巡抚为首，处理军政事务。巡抚任期为五年，五年后可直接入阁。至于奴儿干都指挥使，则是负责屯田，也以五年为期限。期满后可调回内地，官升一级。
此外，其他官佐，在任期满十年之后，也可提升一级，回内地安置。”
见皇上如此安排，方从哲和孙如游都觉得比较满意，便放过此节。和皇帝又闲谈几句，便告辞离去。
方、孙两人走后，朱由校却陷入了沉思。