大金北移，是一个艰苦的迁徙，沿途各城池的女真人都闻讯跟随代善北迁，浩浩汤汤数万人，为了躲避明军的追击，他们只有加快北迁的步伐，尽快渡过黑水，才能免遭被歼的命运。
一路上，每天都有数不清的人掉队，都是老弱妇幼，还有忍受不了极北之地的艰苦，偷偷逃走的也不在少数。
朱由校占领盛京后，就四处派兵收复辽东各地城池，明军所到之处，不是空城就是驻守的金兵望风而逃，短短十余日就安定原辽东故土。
代善虽然向北迁徙，但是还有不少不愿意跟他走的女真遗民，这些留下的遗民自然成了辽东汉人的报复对象，他们曾在女真人的统治者过着奴隶般的日子，不仅生活艰苦，生命也得不到保障，努尔哈赤就像暴君一样动不动就杀汉人掠夺财富，所以他们恨死了女真人。
朱由校为了防止发生女真人与汉人仇杀，在占领盛京后就发布安民令，下令将女真改为满洲，凡是归顺大明的满洲人皆是大明子民，分配土地照章纳税，有报复伤害满洲人者，按律严办，原女真贵族侵占土地一律回收重新分配辽东百姓，鼓励满汉通婚，凡是满汉通婚者，赐三代免除一切徭役赋税。
朱由校的政策，令留守在辽东的满洲人消除了顾虑和恐惧的心理，能够安分的留守在他们的家园，同时对北迁的代善也带来了不小的压力，这么有诱惑力的政策会造成人心浮动。
朱由校派出曹文诏率兵追击代善，然而，追击三百里被莽古尔泰阻挡，莽古尔泰的勇猛威名不是吹出来的，是真真打出来的，曹文诏不是对手，败退回来。
朱由校痛斥了他一番，没有罚他，因为曹文诏是轻兵追击，没有携带火器，再加上莽古尔泰是以逸待劳，失败是情有可原的。
代善率部渡过了黑水，抵达精奇里江以东，这里土地肥沃，水草丰盛，阳光充沛，比起传说中的蛮荒之地简直是世外桃源。
这里远离辽东，想必明军不会再追过来了，于是代善与众人商议，暂居此地，遣部分别驻扎生养，共设六十四部，每部设一屯长，称六十四屯。
朱由校得知代善已过黑水，暂时放弃追击，又闻代善在精奇里江以东地区扎下了根，并建起六十四个屯作为根本，朱由校忽然意识到历史上注明的江东六十四屯竟然是这么来的，不由的产生了一点点的好感，面对诸多将领要求渡江铲除女真残余势力的时候，他没有答应，因为他隐隐的感觉到在不久的将来，他们所面对的压力不再是大明，而是来自遥远的西方。
大金已经元气大伤，几十年对大明不会构成什么威胁了，唯一有威胁的是大明几百年的宿敌——蒙古！
大明与辽东只有一条辽西走廊相连，当前能威胁这条走廊的只有蒙古了，何况，大明二百年来所谓的“天子守国门”针对的是蒙古，这个贯穿整个大明的北方威胁是该在他这里解决了。
朱由校召开袁崇焕，问其策，他对现如今的女真残余北遁极北之地是不屑一顾的，认为那蛮荒的鸟不拉屎的地方，寒冬一至不战自亡。
所以对言：“陛下，首逆努尔哈赤已亡，其子代善智谋不能与其父相比，女真之势十去其九，又在蛮荒之地，生存之艰难非人可想象，陛下既已善待满洲人，恩殊披泽，可感召未降人。臣与陛下所虑略同，北防重心应转移至西部的察哈尔了，若不是我大明与建贼争锋，他察哈尔林丹安有复国之机？北方之患，犹如芒刺在背二百余年，臣建议，派使者出使察哈尔，晓之大义，归顺我大明，免遭努尔哈赤之覆辙。”
朱由校眯起眼睛微笑道：“朕正有挟复辽东之军威，慑察哈尔之意，朕希望能像努尔哈赤一样收服蒙古诸部，永绝北方之患，若能蒙汉一家，则天下太平，朕何愁我大明永不昌盛？”
袁崇焕拱手道：“陛下心系大明千秋，臣仰望不及尺寸。”
朱由校“呵呵”一笑，摆手道:“卿毋需奉承，朕召你来是商议派谁去察哈尔说服林丹汗。”
袁崇焕一听，眉头轻微一皱，不禁犯起难来，他的周围都是武将，鲜有文官，打仗在行玩嘴皮子不咋地的粗人，还真难选出一个合适为使臣的人。
他难色的看了一眼朱由校，但见他凝色盯着自己，不由的心头猛然震惊，暗道:皇帝要让他出使察哈尔？
“陛下，”他冷不丁的一哆嗦，俯首叩拜，不敢抬头的禀道：“臣领兵在外，久不在朝中，不知朝中谁可担此重任。”
“我军中难道就找不出一个可以去游说察哈尔的人吗？”
朱由校问道。
袁崇焕彻底明白了，这是要让他去啊！皇帝不明说，是要他自荐啊！
他愕然道:“臣……臣愿为陛下分忧，前往察哈尔说服林丹汗，但……”他额上浮出浓密的忧愁，担心的说:“林丹汗胸怀成吉思汗之志，只怕不会归顺大明。”
朱由校也不无忧虑的点头，“朕愿意与他联姻娶蒙古王族女子，也愿意派宗室女子嫁给他。”
袁崇焕不解，问道:“陛下，努尔哈赤已除，为何不挟极盛兵威伐蒙，而要联姻察哈尔？”
“女真不过昙花一现，蒙古是我大明百年之患，立国至今未能根除，朕不得不慎重考虑对其用兵。努尔哈赤对我明人虽然苛刻，但在蒙古诸部上的方法十分成功，值得我们效仿。若能成就蒙汉一家，朕何乐而不为呢？朕要试一试，效仿努尔哈赤一次。”
朱由校深有感触的叹道:“人言建州为蛮夷，却最能体会异族之心，在对异族之策上，我们不如他们呀！”
朱由校边说边长声叹息，他认为，女真在在对待异族的政策上是最成功的，否则不会在后来的大一统上凝聚这么多民族，可惜，这样的辉煌历史他们是看不到了，但朱由校要借鉴其精华，学习他们的民族政策，才有利于他将来统一蒙、回、藏、疆。
袁崇焕不知朱由校的深意，但也明白了皇帝内心钦定了他，也不敢再多推迟，于是俯首道:“臣愿前往说服察哈尔，但请陛下开恩，赐一人同往。”
“哦，谁？”
朱由校满意的笑道。
袁崇焕道:“阿巴亥，他是蒙古人，臣想，有他同往，可事半功倍。”
朱由校点点头，同意的说:“嗯，好！你为正使，他为副使，待回来后，朕在京与你们封赏。”
“谢陛下隆恩。”
得旨后，袁崇焕和阿巴亥与第二日离开盛京，率领一队使团向察哈尔出发了，朱由校就留在盛京的宫殿里，像是度假一般静待他们的消息。
他已做好打算，不管袁崇焕此行是否成功，他都会让李如柏镇守辽东，让袁崇焕跟谁他回京任职，日后图谋蒙古诸部，不过说起来，他心里似乎感觉说服林丹汗的可能性不大，因为，林丹汗也是十分有野心的人。
有野心是好的，但是也需要实力。朱由校已经具备了实力，而林丹汗，已经没有机会了，他，要么依附大明，要么从世界上消失。
朱由校在盛京的皇宫悠闲了几日，忽然得到京师内监国信王朱由检的奏报，称南洋近期忽然出现一支不明船队，专门劫掠南洋过往商船，在通往西洋的商船也经常遭到红毛战船扣押，勒索高额费用，令东南沿海商人叫苦不迭，海贸司衙门也纷纷上书，埋怨海盗、红毛滋扰生事，不管是民船还是官船，收益大幅缩水，严重影响了海贸收入，请求朝廷减少海贸司的税负额度，令请求朝廷干预海事，保护大明海商安全。