不过太平洋舰队虽然不敢出战，但仍然经常在港外布雷，加强港口的防御，5月12日48号*艇在大连湾东北的大窑口执行扫雷任务时，触雷沉没；5月14日，通讯舰“宫古”号又在大窑口附近扫雷时触雷沉没。
而这时太平洋舰队布雷舰阿穆尔号的舰长伊万诺夫中校经过观察，发现了日本舰队的行进路线规律，日本军舰基本上是进至港口南方10海里的地方展开炮击的，因此向代理司令维特格夫特建议，在这一带地区布设*，得到了维特格夫特的同意。正好当天起了大雾，于是阿穆尔号出港，在伊万诺夫认定的地点布下了50颗*。
5月15日凌晨1点，第3战队在大雾中监视旅顺港时，发生了军舰撞击，日本刚从意大利购买的装甲巡洋舰春日号与甲午战争中的功勋战舰吉野号相撞，春日号的的冲角撞破了吉野号的左舷，造成大量进水。然而由于在浓雾中的视野近乎零，因此其他各舰无法展开救援。到2点10分，吉野号沉没，舰上共有318人死亡，90人获救。
而这次事故并没有影响联合舰队的行动计划，天亮以后，大雾渐散，第1战队依然按计划前往老铁山东南海域威摄港内的俄舰。而这里正好就是昨天俄舰刚刚布雷的海域。
9点50分，战列舰初濑号的舰尾触雷，一声巨大的爆炸声响起，舰体发生了剧烈的晃动，旗舰附近的水面上一片红褐色。
随行的战列舰笠置号，八岛号立刻采取救援行动。但10点15分时，正准备救援初濑号的八岛号右舷后部也触雷，一分钟不到的时间，右舷前部再次触雷。
这时联合舰队也有些不知所措，不知道到底是触雷，还是有潜艇袭击，东乡平八郎一面下令其他各舰不许轻举妄动，注意防备潜艇，一面命笠置号放出绳索，准备拖曳初濑号，但就在11点35分时，初濑号后部炮塔下方再次触雷，并引发了炮药库爆炸，不到两分钟的时间，初濑号便沉入水中。而另一艘八岛号这时也大量进水，无法曳航，于下午5点沉没。
不过这时旅顺黄金山炮台的俄军虽然已观察到了初濑号、八岛号的触雷，但代理司令维特格夫特只命令各舰派官兵到岸上观摩战果，却没有出动舰队出击，趁势痛击联合舰队，结果白白错过了这个翻盘的大好机会。
初濑号和八岛号均是联合舰队的主力军舰，竟然在一天內同时触雷沉没，对于联合舰队来说不啻为沉重打击。而收到了东乡八平郎的报告之后，军令部也是大吃一惊，军令部部长伊东佑亨害怕如此重大的损失因此影响到官兵及国内民众的情绪，于是命令封锁消息，对外只公布这两艘军舰受伤正在修理中。而为了补充第1战队的战斗力，东乡平八郎只待将刚刚购入的两艘装甲巡洋舰日进号和春日号编入第一战队，勉强凑够六艘之数。而春日号也是在同一天，刚刚撞沉了吉野号。
不过日进号和春日号属于意大利加利波蒂级装甲巡洋舰，排水量仅7700吨，主炮为4门203毫米，战斗力连第2战队的几艘万吨级装甲巡洋舰都比不上，而初濑号、八岛号都是排水量达1.5万吨左右，主炮为4门305毫米口径巨炮，因此第1战队的战斗力自然的大大降低了。
而且联合舰队的恶运却并没有结速，两天之后，炮舰大岛号又和赤城号发生的碰撞事故，驱逐舰晓号又触雷沉没，仅仅只有5天时涧，联合舰队竟然连续损失了7艘军舰，包括2艘核心主力的战列舰和1艘功勋的巡洋舰，好在是这时陆军的登陆基本结束了，因此东乡平八郎下令舰队暂停所有行动，回港修整。
但太平洋舰队仍然没有抓住这个时机有所行动，从而也错过了最后一次扭转局面的机会。
好在是日本陆军并未受海军的影响，当然海军封锁消息的对像也包括陆军，因此陆军根本就不知道海军遭到了开战以来所未有的重创，还以为海军的局面仍然大好。于是陆军在5月25日，发动金州战役，并于5月28日攻占金州，大连，守卫金州、大连的俄军、侨民退到旅顺，至此日军完成了对旅顺的包围，并且完全切断了旅顺对外的一切联系。