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下午三点左右，日本首相山本权兵卫收到了日高壮之丞的电报，当时就吓得魂不附体，没想到长崎发生了这样重大的事件。
在这次访问之前，自己可是对日高壮之丞千叮咛万嘱咐，千万别出事，结果还是出事了，而且一出就是不可收拾的大事，想到这里，山本权兵卫也忍不住把日高壮之丞家里的女性全部问候一遍。但现在事情己经发生了，再说什么都晚了，只看怎么解决。
而就在这时，美国驻日本大使前来拜访，山本权兵卫也只得硬着头皮，接见美国大使。
其实美国大使来向山本权兵卫提出的要求和斯帕雷也差不多，就是释放被捕者，治疗伤员，严惩肇事者，赔偿损失等，而山本权兵卫这时也不能说别的，只能向美国大使要求宽容一些时间来让自己处理，这个要求当然也不过份，因此美国大使给出了48小时的时间，才结束了这次拜访。
送走了美国大使之后，山本权兵卫立刻招集内阁成员协商讨论如何解决这次的长崎事件。
但内阁的各大臣们也众说纷云，藏相高桥是清和外相林董都主张息事宁人，尽快释放被抓捕的美国士兵，并让美国、华东的舰队离开，以免再生事端，现在日本再也经不起折腾；但计相加藤高明则认为在这个时候让美国、华东的舰队离开，只会让民众的怒火转移到内阁头上，不如暂时留下美国、华东的舰队，等着长崎的地方警署查明真像，收集证俱，如果真是日方的责任，也向美国、华东赔礼道歉，但如果是美国、华东的过失，日本也不能有失国体，只将证俱公布于众，相信国际社会自有公论。
而陆军大臣桂太郎则主张这个时候日本绝不能退让，必须以强硬姿态对待美国、华东，严惩被捕的美国士兵，同时他还严厉的指责海军的监管不严，才闹出这样的事情来，要求海军要对此负全部责任。其实在内阁收到日高壮之丞的电报时，日本陆军参谋部就己经得知了这次事件。
原来在山本权兵卫出任首相之后，日本陆军一直耿耿于怀，总憋着找海军的过失，将山本权兵卫从首相的位置上赶下去，重新夺回首相的宝座，于是在长崎派驻了大量的情报人员，一有风吹草动，就立刻向陆军参谋部报告，因为长崎是日本海军的大本营，在这里容易抓住海军的把柄。而得知长崎事件之后，陆军如获致宝，认为这是一个令山本权兵卫内阁倒台的大好时机，于是在这次内阁会议上，桂太郎有意将矛头引向海军。
但海军也不是吃素的，海军大臣伊东佑享立刻站出来为海军辩解，称这次长崎事件只是一个意外，并不是海军的过失，然后又指责桂太郎在这紧急时刻，仍然不顾大局，只为谋求私利的举动。而这下揭了陆军的老底，桂太郎也有些羞恼成怒，于是反唇相击，一下子日本海陆军的矛盾又一次爆发出来，两人越说越激烈，在内阁会议上吵了起来。
其他人赶忙来解劝，好说歹说总算是将两人劝开，这时又有人提出一个建议，认为不如就借这次长崎事件之机，将过失全部推到美国、华东身上，然后将两国的军舰扣下来，留为日本所用，这样一来日本一下子可以得到20艘战舰，其中有16艘都是战列舰，实力可以一举越升到世界第三的位置，远超过华东的海军，日本也就不用在对华东忍气吞声了。而失去了环球航行舰队之后，美国海军根本无力和日本抗衡，也只能忍下这一口气。
听了这个建议之后，山本权兵卫差点一口老血喷了出来，这是把国家大事当黑帮火拼吗？且不说现在美国、华东的舰队大部份都驶出了港口，在港口外驻泊，就算是在港口里停着，也不是日本说扣就扣的，那可是16艘战列舰啊，即使是在港内这种水域狭窄的区域，也同样具有极为强大的战斗力，就算最终日本凭港口内的火力取胜，但至少也有近一半的军舰可以突围成功，而剩下在港内的另一半，大多也会被击沉，日本最终能够俘虏3、4艘军舰，就是最好的结果了，而且俘虏的军舰也肯定是伤损严重，没有1、2年时间，是不可能修复的。那时即使美国海军没有来找日本麻烦的能力，但华东的海军可不是日本海军能够抗衡的对手，根据日本获得的情报，华东己经修复了6艘在远东战争中俘虏的战列舰，即使是退役了两艘，但现在战列舰的数量己达到了12艘，日本拿什么和华东对抗。