在将校学员训练紧锣密鼓的进行着，李定国对中军整编也提到日程上，虽然过去各部多番进行整编，但毕竟乃流寇出身，不但有大量随军家属，而且有太多老弱病残，如此真正可堪一战的将士甚少。
看着全军上上下下五万张口，看着很多人连三餐都不能充饥，看着这一切，想到因为连年混战，各地出现太多荒废的土地，想到如何控制地方政府，在回到梧州之后一个月，李定国决定整编军队。
经过十余天商讨，李定国决定从中军开始进行整编，将军中家属所在的后军不动，对近三万中军进行重编，淘汰一些老弱病残，以提高战斗力。
李定国当然知道淘汰伤残可能影响士气，影响战斗力，当然也不可能干这种亲者痛仇者快的事情，在进行整编的时候对这些将士可多有照顾。
如今不是控制柳州府、平乐府全境、梧州府一部吗？各个府衙、县衙需要衙役，李定国亲自挑选上百个断胳膊断腿的转为衙役的门子，转为牢房禁卒，选派百余有功人员充作普通衙役，如此不但加强对地方监视，而且还解决了这些人生路。
自古以来公家人表面俸禄不高，但大家都有大量来钱的门路，这些转为衙役的不但没有丝毫抱怨，而且还感恩戴德。
除此之外，就是在柳州、平乐、梧州等地建立20个军屯之所，每个人发放30亩土地，衙门将种子、粮食、耕牛等农具按照1分利息贷给大家，在前三年免征各种税赋，三年后正常缴纳田赋、丁赋，若能在未来10年完全还清费用官府所贷给物资，这些土地将无偿分给大家。
大家一个个鞍前马后的不是为了混一口饭吃吗？梧州、柳州、平乐丘陵、山地虽然颇多，但土地肥沃，选定军屯场所多是平原地区，听到这个政策，很多人都动了心思愿意就地转业。
通过转业，通过军屯，可以解决5千余人的生计，再加上即将建立的军械所、后军等家属营，完全可以解决淘汰下来将士的生计问题。
在这之后，李定国于五月中旬正式宣布改制，所部明军（大西军）正式改编为国民军。
《周礼》规定传统军队编制为“五人为伍，五伍为两，四两为卒，五卒为旅，五旅为师，五师为军”，历史上太平天国好像完全按照这种方式编列各军。
除此之外，在历史上军队一般分为前后左右中军，在大西军中左右前中四军主要为战斗部队，后军则主要提供后勤保障。
按照现代编制，将后军改为辎重营，妇女营，军械所，委任刘远生负责大军辎重，委任赵范负责军械所。
对左右前中四军进行整编，结合戚家军、传统兵制、前世军队编制与周礼有关军队编制，建立小队、中队、大队（局）、营（司）、团（部）、旅（营）六级国民军编制，其中：
小队（戚家军称为小旗），12人，包括小队长1人，伍长2人，兵丁8人，伙夫1人。
中队（戚家军称为总旗），37人，包括中队长1人，三个小队。
大队（戚家军称为局），120人，包括大队长1人，司务1人，伙夫1人，护勇6人，外加3个中队（比戚家军多了8人）。
营（戚家军称为司），500人，包括营长（把总）1人，指导员1人，医官2人，伙夫4人，护勇12人，4个步兵大队（其中1个步兵大队含1个虎蹲炮中队，装备10门虎蹲炮，1个抬枪中队，装备16柄抬枪。）
团（戚家军称为部），1800人，包括团部20人（其中团长（千总）1人，主薄1人，参谋股长1人，参谋4人（作战、情报、军需、宣传），医官3人，教导官5人，伙夫5人）,1个骑兵中队（30人），1个护卫中队（30人），外加3个营（司），2个辎重大队（200名长夫、工匠）。
乙种旅(戚家军称为营)，4100人，包含旅部14人（参将旅长1人，佥事1人，参谋长1人，参谋6人（包括作战、情报、军需、宣传各2人），医官2人，伙夫3人）,2个警卫中队（60人）、2个骑兵中队（60人），1个辎重营（3个大队），外加2个团。
甲种旅（戚家军称为营），6200人，包含18人（副将旅长1人，佥事1人，参谋长1人，参谋8人（包括作战、情报、军需、宣传各2人），医官3人，伙夫4人）,1个护卫大队（100人）、1个骑兵大队（100人），1个辎重司（营），1个佛郎机炮大队（10门佛郎机炮）、外加3个团。
（为了方便读者，下文将逐步改变过去那种局、司、部、营编制叫法，改为大队、营、团、旅的叫法，以与现代军事单元保持一致）
对大西军进行整编，按照《周礼》兵制与现代兵制进行整编，整编后国民军包括9个步兵旅1个骑兵旅，分别为。
第1旅为甲种旅，作为警卫旅，由李定国亲率，李如碧、杨成、高恩等分任警卫团长，由原来中军与火器营改编而来。
第2旅旅长王国仁，杨武伯等人分任团长，由原来天威营改编而来。
第3旅旅长李成爵，高启隆等人分任团长，由原来强弩营改编而来。
第4旅旅长窦名望，史文等人分任团长，由原来中军一部改编而来。
第5旅旅长王之邦，李本高等人分任团长，由原来左营改编而来。
第6旅旅长靳统武，赵武等人分任团长，由原来坐营改编而来。