禹在羽山只找到了父亲的陪葬品，还有空空如也的青铜棺木，在逼问了许多战俘后，也没有得到父亲尸身的下落，失望非常。
尧在追上禹后，也前往羽山祭奠，只是身为大帝的他，不论修为还是阅历，都要比禹强的多，他明显的感到事情不对劲。鲧的陵墓血煞之气极重，阴气刺骨，遍体生寒。在注视棺木许久后突然闷哼了一声，脸色苍白的对禹说：“你父或许真出事了。”
禹在将自己先前所问到的情况和尧交代后，尧的脸色更差了。尧在早年时曾今征战三苗，其首领驩兜(huāndōu)便是在战死后冤魂不散，变成了凶兽饕餮。那时尧花费了数年时间才将其剿灭，为此牺牲了无数将士，令尧心痛至今，现在鲧墓穴的变化像极了那个时候驩兜变化的情形，自然令其变色，就将自己的担心告诉了禹。
禹却是沉默以对，心中对尧的猜测多少有些不喜，即便鲧真变成了凶兽，但此时并没有伤害到平民百姓，杀的都是那些入侵的共工氏。看尧的意思似乎是要对斩杀父亲的异变体，这让身为人子的禹如何能够接受，只能默不出声以示反抗。尧阅人无数，知道禹一时间不能接受，便不再说了，只是拍了拍他的肩膀，安慰了两句。
禹之后简单的收拾了一番之后，便踏上了寻找父亲尸身的路，虽然知道尧的话应该是对的，但是他还是想亲自去证实一下。自此，禹游走华夏大地，寻父的同时细心观察各地山川河流走势，请教了不少当地有学识的老人，还有许多有过治理水患的能人。
时间一晃便是5年，当禹回到尧身边时，再次请命由他来彻底根治水患，尧笑了笑便许诺了，送他一把开山斧，并请来了天界应龙等以助其力。禹发动万民，重新修建河道，这一次不再是单纯的堵，他将黄河水引向了无人居住的山川峡谷之内，开凿出了新的河道，使之原本贫瘠的土地在洪水过后渐渐变得丰润起来，许多家园被毁的百姓也都搬迁至此，华夏文明也随着黄河支流的扩张而向外扩散这，禹将原本的灾难转化为了有利的事情，令天下人刮目相看，有功于天下，这也为将来他坐上大帝之位奠定了基础。
唯一对此不满的只剩下东皇太一了，只是这是他也不敢再肆意妄为了，黄帝带着颛顼等大帝一脚便端开了他的宫殿大门，警告他不要太过分，虽然当初承了他的情，下届毕竟是自己的子民和后代，当初说好的享有万民愿念也做到了，只是你们这些天神自己不争气，丢失了百姓的信任能怪谁。
太一气极想动手，被近臣给拉开了，如今黄帝一脉非比寻常，天界中如应龙、风伯等神兽神将都与他们非常亲近，甚至隐隐有为其下属的意思，太一要想动手就要好好掂量一下自己的力量现在还有多少。太一也是一时失常，一瞬间就反应过来了，只是面子上过不去，冷哼了一声甩手就走。黄帝等人对视一眼便笑了笑散去了，如今人间力量已近在天界扎下了根，从此天界便不能再对人间指手画脚，这也是当初黄帝选择来天界的目的之一，神并不是万能的！
回归正题，尧在退位后将帝位交给了舜，舜又传给了禹，禹成为了太古时代的最后一位大帝。在禹的晚年，天界传信，说是天地发生巨变，有一样神物即将现世，世界各地的神族都会进行争夺，胜利者可以通往更高层的宇宙空间，黄帝令大禹尽快安排好人间诸事，飞升至天界，以增强华夏神族的实力。（禹在人间留下了后手，此处就不再详说了，以后会提到的。）
也许是诸天变化造成了影响，又或是上天怜悯，希望离散前父子能够相间，失踪了数十年的梼杌，也就是变成凶兽的鲧出现了。原来当年棺木中的血色胚胎还未完全长成，被共工氏的人坏了好事，结果成为了一个半成品，它在出来后不断的袭击共工氏的人吸食血肉来弥补先天的不足，而最后一次在吸食的麟兽的血后，那体内的一丝麒麟精血令它彻底补全了缺陷，躲进东方山林进行最后的进化。
禹接到线报说东方有魔兽作乱，百姓伤亡严重，地方无力清剿，禹便带着开山斧去除害了。可是在见到梼杌的第一眼后，他就感觉到了，那就是他的父亲，只是此时此刻，再重逢，早已物是人非，那只是一个由怨念而成，满脑子杀戮的怪兽，再也找不出当年豪情万丈的大英雄鲧的一丝一毫。
凶兽的力量之大，便是一般的神兽来了也得伏诛，可是禹是什么人，上古五帝之一，翻手为云覆手为雨，移山填海都是寻常。大战后，禹终将梼杌击成重伤，却无法下手杀害，一番思量后拿出了一个挂饰，低语几句，挂饰发出青光，变成巨鼎。