皇帝确实被箭射中了，而且伤得很重，两支箭分别插在了他的左肩和右肋，幸亏刺客所用的是一种手弩，劲道较小，离得又不是很近，所以才没有立时致命。不过，纵然是这样，皇帝仍是流了不少血，而且当场昏迷，直到第二天早上仍是神志不清，连话也说不出一句完整的。与皇帝一起中箭的还有一名抬御辇的太监和两名大臣，他们的伤势比皇帝轻，并无性命之忧。
当时事发突然，众人又都忙着救治皇帝，再加上刺客行凶后立刻逃走，所以并未当场捉住刺客，仅在附近找到五张手弩，看起来刺客至少是五人，其中有三支箭射偏了，若非如此，恐怕皇帝当场就会死去。
由于皇帝是在黄得功大营外中的箭，所以黄得功实在是脱不了干系，在众人的诘责和猜疑下，黄得功自知理亏，当即闭营不出，只是派出兵丁满城捉拿刺客。
皇帝遇刺以后，刚刚有些明朗的形势顿时又变得扑朔迷离起来，所有的人都在猜测幕后的真凶，而那些文官更是将主要的怀疑目标对准了前来勤王的诸军将，一时之间，各种猜测纷起，小道消息满天飞，若非因为城内处于军事管制之下，百姓们对此事还几乎一无所知的话，恐怕南京城内又要谣言四起了。
作为文官名义上的首领，史可法一直处于焦虑之中，他既担心皇帝的安危，又急切的想搞清楚此事的真相，他的心中隐隐的觉得此事一定隐藏着什么不可告人的秘密。作为应急手段的一种，史可法召集了所有文官，与他们共同商议对策。
众人商议来商议去，却仍是一筹莫展，对于他们来说，目前最重要的还不是找出真凶，而是如何救治皇帝，若是皇帝真的就此升天而去的话，整个明朝就可能迅速陷入更大的混乱之中。
一名大夫刚刚退出皇帝的卧室，史可法立刻迎上去问道：“皇上的伤可好些了？”
大战之后，原侍奉于皇宫中的御医大多不知去向，这些为皇帝治伤的大夫都是从城中各药铺找来的坐堂大夫，虽然他们中不乏医术高超之人，但面对如此重的伤势，仍是束手无策，况且当他们得知伤者是大明朝当今天子之后，就更是畏首畏尾，不敢尝试大胆一点儿的治疗手段。
这名大夫显然也毫无办法，他叹了口气，道：“小人行医数十年，虽曾救治过一些受了刀箭之伤的人，但如此重的伤小人还是第一次见到。皇上的伤口有两处，一处位于肩胛一侧，这个地方并无大碍，只要将养些日子就没事了，麻烦就麻烦在右肋的那支箭上，那支箭插的较深，而且在挪动皇上身子的时候，箭杆儿碰断了，箭头深嵌在肉里，无法取出。根据从肩胛上拔下来的那支箭来看，箭头上有倒刺，小人曾试着用薄竹片夹着轻轻拔了拔，但却发现那箭的箭头好象卡在了肋骨上，根本拔不动。若是硬将其拔下来，则皇上的伤势可能更重，但若不拔，则箭头留在体内越久，其所发的创毒就越烈，这样一来，皇上的伤势还是难以好转。所以，现在小人很是为难，特前来向大人问策，看大人如何决断。”
大夫轻描淡写的几句话就把包袱扔给了史可法等人，将责任也推了回去。
史可法等人一听这话，个个紧皱眉头，要知道，这皇帝的龙体可是金贵的很，越是在这种时候，做臣子的越是不能轻易表态，万一皇帝真有个三长两短，那还不是往自己脖子上套绳子吗？所以众人均是闭口不言，齐刷刷的将眼光盯在了史可法身上。
史可法当然知道同僚们打得什么主意，但他却不敢做主，他轻声沉吟道：“可惜宫中没有太妃等皇上的长辈，否则此事就较易办了！”
那大夫见众人沉默不语，知道是自己的恐吓计策起了作用，为了尽早使自己摆脱这个救治天子的重担，他赶紧加上一句：“其实也并非全无办法，要想把断了的箭头拔出来，可以用刀将皇上伤口附近的肉割开，然后一点一点的将箭头挖出来，而且一边割一边要用针线将伤口附近的疮口缝起来，以免流血过多。不过现在皇上龙体虚弱，若这样拔箭头的话，恐怕……。小人之所以前来向大人问策，是因为小人医术有限，没有华佗那样的本事，即使让小人来拔，小人也不敢动刀，恐怕还需另请高明。”
“什么？”一听大夫这样说，所有人都愣住了。
史可法问道：“你是说若想把箭拔出来，还必须先将皇上身上的肉割开？”
“正是！”大夫面色如常的答道。
“那样一来，流的血岂不是更多了吗？”张慎言有些紧张。
大夫道：“所以要一边割一边缝，将所有伤口都缝起来，不使其继续流血。”
“这……这……这……”张慎言已经说不出话来了。
史可法心中一阵惊慌，但他脸上仍是毫无表情，他向那大夫说道：“你进去继续守着皇上，看看其他大夫还有什么计策没有。”
待那大夫转身走进皇帝卧室，张慎言“扑通”一声跪倒，老泪纵横，连道：“苍天啊！你不公啊！”
史可法赶紧拉起张慎言，道：“张大人切莫如此，万一让其他人知道，恐会引起诸多猜测，于大局不利。”
史可法沉吟片刻，道：“事已至此，做臣子的不能不有所准备，我这就派人去将朝臣召集起来，共同商议此事。”
“咔”的一声轻响，林清华将手中的一截树枝折断。
莫不计伸手将林清华扔在桌上的半截树枝拿起，放在手中把弄着，口中却道：“此事会是谁干的呢？谁会想刺杀皇帝呢？”
林清华将手中的另外半截树枝也扔给莫不计，说道：“依我看，谁都有可能。不过，这还要看谁能从这件事上得到最大的好处，可能得到的好处越大，那么他的嫌疑就越大。”
“莫非是黄得功？”莫不计喃喃道，“皇帝是在他的大营外遇刺的，而刺客显然对那里的地形很熟悉，而且他们对于皇帝出来的时机把握的也很准确，若不是黄得功，那谁能弄得这么清楚呢？”他闭上眼睛，仔细的想了想，随即又摇了摇头，把自己的这个怀疑给排除了，“若真是他，恐怕他就是个十足的笨蛋，可我怎么也看不出来他是个笨蛋，所以幕后主使不可能是他。”
林清华道：“我也觉得不可能是黄得功，以他的为人，不可能把把柄落在别人的手里，除非他疯了，或者是傻了。”
莫不计将手中的两截树枝折成更多节，用它们摆出了个卦，他仔细的研究了半天，忽然说道：“从卦上来看，皇帝是半凶半吉，其中凶者在东方，吉者在西方，只是这卦象太模糊，一时半会儿还弄不明白，而且看起来好象是个死卦，没法继续解下去了。”
林清华低下头来，看着莫不计摆的那个卦，没好气的说道：“这种东西信则有，不信则无，没意思！”
莫不计道：“侯爷此言诧矣！我这卦象可不是一般的算命先生用来骗人的玩意儿，这可是我花了十年心血弄出来的一套新的卜卦之法，其脱胎于易经，又糅合了佛道两家之长，既可算天地之象，又可测人世之情，所谓鬼神莫测，讲得大概就是我的这种卜卦之法了！”
林清华伸出手去，将莫不计摆出的卦推乱，道：“现在你再看看，这卦上又说什么了？”
莫不计还真的看了起来，看了片刻，他抬起头，疑惑的说道：“咦！侯爷这轻轻一推，怎么又把此卦给推活了？”
林清华很想听听他到底怎么吹，所以故做好奇的问道：“哦？我这么厉害？你说说看。”
莫不计指着桌子上的卦象，说道：“侯爷请看，此卦本来是东方西方互不相让、势成水火的，可现在经你的手一推，卦象上已经发生了很大变化，东势金象疲弱，而西势火象崛起，这火克金之势已成，可见此次皇帝还是有可能转危为安的，不过……”
“不过什么？”林清华追问道。
莫不计将眉毛一挤，脸一皱，说道：“不过这卦象上还说，在南边还有一水象，这水克火，可见前途仍是十分的迷茫，只是现在这水象势颓，好象还欠一助力。”
林清华对于莫不计讲的这些东西一点儿也不信，他懒洋洋的说道：“那依你这样说，岂不是我救了皇帝？可是眼下我既不会医术，也不会起死回生的本领，你叫我怎么救他？”
“这个……”莫不计显然也无法解释这个问题，正当他陷入迷茫之中的时候，帐外一名卫兵进帐禀报，说帐外有一女子求见林清华。
“女子？”林清华心中升起个问号，“莫非是萍儿她们去而复返？”他不敢耽搁，立刻迎出帐去。
出了帐，却见帐外果然立着一名女子，此人身材娇小，瓜子脸，丹凤眼，看似若不经风，但眼神中却有一种说不出来的坚毅。
林清华立刻愣住了，不为别的，只因为他是认识这女子的，此女不是别人，却正是那秦淮八艳之中的李香君。
不待林清华开口，那李香君却先跪下了，她一边用手帕擦拭着眼角的泪水，一边哭道：“香君求侯爷救我家官人一命！”
林清华赶忙抢上一步，扶起李香君，正茫然间，忽闻身后的莫不计轻轻咳了两声，方才反应过来自己的举止有些卤莽，遂赶紧放开手，也轻咳两声，说道：“香君小姐为何这样说呢？候兄不过是暂时被囚禁，还谈不上有人要杀他吧？”
李香君道：“侯爷莫非还不知道？”
林清华有些迷惑，问道：“知道什么？”
李香君叹了口气，道：“看来侯爷真的不知道。原本事情确如侯爷讲的那样，我家官人暂时并无性命之忧，但自从昨夜皇帝遇刺后，情形就大变了，那张慎言……”
林清华打断她的话，问道：“你怎么知道皇帝遇刺的？”
李香君道：“我家官人为官很有些日子，官场上的朋友还是有一些的，香君就是听官人的一位好友说的，但请恕香君不能说出他的名字。”
林清华道：“这我理解。你快说说这到底是怎么一回事儿？侯兄遇上什么凶险之事了？”
李香君道：“我家官人要与数百名潞王的官员一同问斩了！”
“什么？”林清华与莫不计同时一惊，林清华忙追问道：“你再说一遍，仔细说一遍！”
李香君道：“今日中午时分，奴家正在屋中与婆婆商议如何搭救官人，却听有人传来消息，说官人要与其他人一同问斩。奴家大惊之下追问，方知原来是因为皇帝遇刺，危在旦夕，而那张慎言等人为了泄愤，便要加害那些被俘的潞王官员。奴家彷徨无计之时，幸得官人的朋友指点，得知侯爷就在此处，奴家心想侯爷与我家官人好歹也曾共事一场，况且交情非浅，所以奴家就冒冒失失的赶来了，若有冲撞之处，还望侯爷莫怪。”说到这里，她已是泣不成声，大有梨花带雨之势。
闻听至此，林清华与莫不计对望一眼，他们都有些惊诧。在林清华看来，张慎言是东林党的代表人物，而侯方域、方以智、冒襄、陈贞慧等人均为复社中人，按说他们应该互相提携才是，可现在却是如同仇敌，看来在政治上确实没有什么永远的朋友。
林清华安定心思，问道：“现在他们人在何处？”
李香君道：“已经押往朝阳门外，只等朝廷下令，就要开刀问斩。”
林清华不敢耽搁，向莫不计吩咐几句，令他速速前往顺天府，随后他亲自率领一个营的镇虏军赶往朝阳门，试图阻止行刑。当赶到朝阳门外时，他才舒了口气，因为那些所谓的潞王党羽还好好的跪在城墙根儿下，行刑还未开始。
林清华找到监刑的一名刑部司员，向他询问情况。
那司员见是威毅侯前来，也不赶怠慢，当下一五一十的将事情的详细经过讲了出来。原来，张慎言见皇帝伤势极重，很可能因此不治，所以迁怒于他人，认为是潞王一伙儿造成了现在这不可收拾的局面，故而擅自做主，跳开沐天波，命刑部派人从黄得功大营中将潞王党羽全部提出，押往城外，只等皇帝归天就开刀问斩。
事情既已清楚，想到李香君那哀怨的眼神与梨花带雨的模样，再想起自己与侯方域等人的交情，林清华觉得自己不能见死不救，他对那司员说道：“这些人没有经过会审，也无判斩的公文，不合朝廷规制，暂停行刑。”
司员道：“可是下官是奉了张慎言张大人的命令，况且史阁部与诸位大人都没有异议……”
林清华打断他的话，说道：“你不用说了，我的命令就是暂停行刑！”他将手一挥，召来镇虏军的营长，命令道：“没有我的命令，任何人都不准行刑，否则你就开枪！”
那营长当即指挥部队围住法场，刀出鞘，枪上膛，将刽子手赶出法场。那刑部带来维持秩序的兵丁自然也不肯退让，双方箭拔弩张，一时之间法场之上杀气腾腾。
那司员见林清华不肯退让，彷徨无计之下，只好派人回顺天府去向张慎言等人禀报。
双方就这么对峙着，人人手心都捏着一把汗。林清华悄悄吩咐一名士兵到军营去，再调两个营前来，以便加强己方实力，以防万一。
援兵未到，史可法却先一步赶来，他骑着一匹马奔进法场，马还未停稳，他即跳下马来，跑到林清华身前，道：“史某来迟一步，险些耽误大事！”
林清华道：“史阁部，昨日朝堂上不是已有成议了吗，凡潞王党羽皆需交黔国公审理，未审明之前，一律暂押大营之中。但今天却突然将他们拉出来处死，这可坏了规制啊！”
史可法将林清华拉到一边，歉然道：“威毅侯莫怪。此事实在是太突然了！”他押低声音，说道：“皇上遇刺以后，伤势不但不见减轻，反而更加重了，如今已是昏迷不醒，所以众臣才会着急，急怒攻心之下，张大人便认为潞王党羽一案事应从权，应立即将所有党羽处死，以免夜长梦多。”
林清华道：“夜长梦多？岂有此理！今日一早我就听说那潞王咽喉中刀，已经死于乱军之中，元凶已毙，党羽能有什么作为？何来夜长梦多之说？况且这么多人，谁是党羽，谁人无辜，你我等人怎能说得清楚？此事依我看，是那张慎言等人发了疯！不过，我就不明白了，史阁部可是明白人，你怎么也同意这么干呢？”
史可法道：“当时史某也是彷徨无策了，心中慌乱至极，以至于未能思虑万全。刚才莫师爷奉侯爷之令前去找我，当时我就觉得自己有些卤莽了，当刑部的人也回去禀报这里所发生的事时，我就更着急了，便急匆匆赶来，所幸来得还算及时。”
林清华道：“那，现在这些人该怎么处理？”
史可法道：“我赶来时已与诸位大人商议了，这些人还是先押回顺天府大牢，待审明之后再行处罚。”他顿了一顿，又道：“威毅侯最好也与我一同返回顺天府衙门，因为有要事与诸位相商。”