一
全国平定后，陆少阳在中央党组会议上提出，为适应新的形势需要，应健全党的组织机构和领导机关。各人均表赞成，斟酌再三，决议更名为中国共和党。
1912年10月1日，中国共和党第一届全国代表大会召开。
大会选举出第一届中央委员会。陆少阳任中央委员会主席。中央委员会的领导机构是中央政治局、中央政治局常务委员会和中央委员会主席，均由中央委员会全体会议选举产生。下设书记处，同时设立中央纪律监察委员会。中央委员会全体会议闭会期间，中央政治局行使中央委员会的职权，政治局常委会处理日常事务。原中央党组成员陆少阳、石铮、秦长风、任安平、卫青五人组成中央政治局常委会。
与此同时，石铮也在积极筹划解放军的正规化建设。经总统府批准，中国人民解放军总司令部下设机构有：总参谋部、总后勤部和总装备部。同时设置各军种、兵种领导机关。
海军司令部：下设后勤部、装备修理部，江鹄出任海军司令。空军司令部：设后勤部、航空工程部，高唯任空军司令。炮兵的领导机关则是总参谋部炮兵部，下设司令部、后勤部。工程兵领导机关是总参谋部工程兵部。通信兵部领导机关是总参谋部通信部。
由于国家初立，各地尚处于军管时期，所以撤销各野战军司令部，设立地区军政长官建制。第三野战军司令胡铁调任华北军政长官，驻节北京；共和国第一军军长杨霆调任西北军政长官，驻节兰州；第二野战军司令王啸飞改任东北军政长官，驻节沈阳；第四野战军司令陈炯明改任华南军政长官，驻节广州；第五野战军司令蔡锷改任西南军政长官，驻节昆明。
随着正规化建设的深入，规范军衔制的问题被提上议事日程。共和革命爆发后，南京政府和各地义军为外交便利，曾临时授予过一些从事外务工作的军人将校军衔。但令出多门，名称和徽标也是五花八门，极为杂乱。
在石铮亲自领导下，总参谋部拟出了一个完备方案。经孙中山批准，于1912年12月1日正式实行军衔制度。
参照世界各国军衔制度，解放军军官军衔设4等13级。
1元帅：中华共和国元帅、军种元帅（陆军元帅、海军元帅、空军元帅）。实行两级元帅制，以共和国元帅为解放军最高军衔。
2将官：大将、上将、中将、少将、准将。准将军衔的设置，是经过反复推敲的，借鉴了西方传统型军衔制度的特点。严格地说，准将既不属于正式将官，又不属于校官，而是作为将官和校官之间的一个特殊层次。以长远的眼光看，中国作为一个国土辽阔、边境线漫长的大国，常备军规模必定非常庞大。而作为基本战术兵团的旅级指挥官数量也将相当大。如果大部分授少将，将官数量过多；如大部分授上校，则显得军衔偏低；因此准将军衔主要对应于旅级军官，比较适合中国国情。上将、中将、少将、准将分别为战区（或集团军）司令、军长、师长、旅长的编制军衔。其实这四级军衔的法文原意就是“集团军将军”、“军将军”、“师将军”、“旅将军”。大将军衔平时基本不用。
3校官：上校、中校、少校。对应团、营级军官。
4尉官：上尉、中尉、少尉。对应连、排级军官。
海军、空军军官在军衔前分别冠以“海军”、“空军”。专业技术军官则在军衔前冠以“专业技术”。
士官的军衔等级分别为，士官：军士长、专业军士；军士：上士、中士、下士；兵：上等兵、列兵。
军衔晋升采取自然晋升和选拔晋升两种方式。校、尉官采取自然晋升制，将官采取选拔晋升制。自然晋升是指军官按规定的年限逐级晋升，一般到年限即可晋升至高一级军衔；选拔晋升是指军官的晋升没有年限规定，根据军官本人表现和工作需要以及编制军衔的空缺情况而定。尤其是将官以上军衔，以当前解放军总规模厘定名额为300-500人之间，在将官定额内，缺一晋一，以控制将官数量。
1912年12月11日，参议院通过了授予解放军总司令石铮中华共和国元帅军衔的决议。同日，中华共和国总统孙中山向黄兴、胡铁、王啸飞、杨霆、陈炯明、蔡锷6人授予中华共和国上将军衔。同时发布命令，授予石龙等65人中将军衔，授予255人少将军衔。江鹄、高唯分别被授予海军中将、空军中将军衔。对于参议院提请的授予总统共和国大元帅的荣誉军衔，孙中山坚辞不受。
南京总统府内，孙中山和陆少阳促膝长谈。这几日两人无数次商谈的都是同一个问题：迁都。其间不止一次提起明朝的迁都故事。朱元璋建立明朝时定都在南京，传到明成祖朱棣的时候，迁都北平。这一政治中心的变化，对全国的政治经济形势均发生了积极的影响。以史为鉴，现今共和国的局面和明朝时候极其相似。孙中山沉吟道：“历史上，历朝历代不是把京城定在西安，就是开封， 要不就是南京、北京。我们的首都究竟定在哪里合适呢？国家初立，百废待举，我们一定要尽快拿出个主张出来。”