塞佛离开已经有一个星期的时间了，尼布甲尼撒号的船员们却依旧没有从他背叛和离去的阴影中走出来。
期间墨菲斯向船员们坦白了从监视到诱饵行动的全过程，并阻止了斯巴克，主动揽下了所有的责任。出于对墨菲斯长久以来的信任，大家又都是意志坚强的人，虽然多多少少会有一些想法，但并没有因为其暗中的行动，以及塞佛的激烈言辞而产生动摇。
尽管塞佛最后背叛了大家，甚至险些将大家陷入险地，但是大家对于他的死仍旧感到了浓浓的悲伤。表面上，谁都没有说什么，依旧按部就班的生活，可九年同甘共苦，一起出生入死培养出来的感情又怎是轻易可以磨灭的！墨菲斯更是异常的内疚和自责，他固执的认为如果自己可以早一点发现，或者听从斯巴克的建议，早点出手，或许还有机会在塞佛做出不可原谅的错误之前，挽救那迷失的灵魂，他挚爱的战友。
可惜并不是所有的事情都拥有重头来过的机会。
战斗远没有结束，生活还要继续。
带尼奥见先知的计划被提上日程。
这一日，墨菲斯一行人再度进入矩阵世界。
按照先知的规矩，她单独接见了尼奥。
斯巴克对于墨菲斯解放心灵的说法一直有种模糊的感觉，可就是怎么也抓不住关键的地方。此时两人都在客厅等候，便聊了起来。
对于之前的说法，墨菲斯进行了详尽的解释。
“心灵的力量是看不见摸不着的，却实实在在的成为了我们的原动力。
简单的说来，有的时候，你应付不了生活，那么你就该用一只手挡开点笼罩着你命运的绝望，同时，用另一只手记下你在废墟中看到的一切。
我们选择了一条荆棘之路，故而需要走过太多的废墟，如果没有心灵力量的保驾护航，而是一味沉溺其中，无法自拔，就可有成为下一个……算了。
与此同时，心灵的力量又是一把枷锁。它模糊了你的视线，束缚了你的想象力，将你固定在一定的范围内。
就好比在模拟对战中的你，你认为自己将力量和速度发挥到了极致，于是那里便是你的极限。然而我并不这么认为，所以我可以比你更快，更有力。但是虚拟的世界毕竟来源于现实，我同样也自己的认知所束缚。
每个人都依靠自己的知识和认知，却又被其所束缚，还将这些称之为现实。但知识和认知是非常暧昧的东西，那个现实也许不过只是幻觉，人们都活在自我意识之中，你不这样认为吗？
解放心灵就是让你强行解开这种束缚，打破原有的认知，从而突破极限，让心灵的正能量无限的扩大，进而体现到你身上的方方面面！
当然了，这不是一件容易的事，每个人所能做到的程度也各不相同。我们都需要更加深刻的体会和不断的历练。”
“那特工呢？说实话，那次和特工交手，真的感觉很无力，他们就仿佛不可翻越的延绵山脉。我甚至不知下一次自己是否有勇气再次面对他们。”
“斯巴克，其实你大可不必如此。你已经做得很好了。敢于说出心中的恐惧，这将有助于你今后直面未知的黑暗。
而且，对于特工，你也不必介怀。他们和我们不同，他们是电脑人，没有心灵的力量。他们只是将母体赋予他们的力量最大化的表现出来。虽然非常强大，但极限就在那里，永远无法突破。当我们中有人能够完全解放心灵的时候，纵使他们可以避开枪林弹雨，亦将不足为虑，因为我们甚至无需躲避。”
“你是说尼奥？”
“也不尽然，只能说我相信尼奥就是那个人，相信他是最有可能或者说最早做到这一点的人。