北路江阴克复，周盛波、潘鼎新等两路淮军作战也相当顺利，经过近半年的战略进攻，淮军已夺取了苏州外围防线上几乎所有的战略据点，对苏州形成了北自福山、常熟，西北至江阴、杨库，东至太仓昆山，南至吴江、震泽的包围圈，原来展障太平天国苏福省首府的战略重镇，而今已尽成为淮军进攻苏州的前进基地。
为了取得苏州争夺战的最后胜利，曾纪泽亲赴前线督战，面对苏州坚固的城防体系，依旧采取缩小包围圈，压缩太平军防御纵深的攻坚战术，加速对苏州的进攻，苏州争夺战的帷幕已经拉开。
淮军东线的进攻还算顺利，西线孤军深入天京腹地湘军曾国荃部日子就不那么好过了，尽管他依靠深沟高垒的防御体系，先进击败了数次天京太平军的进攻，但时间进入9月，一场突如其来的大疫却将曾国荃逼向了败溃的边缘。
这场袭卷江南的大疫，使得大江南岸的湘军各军疾疫盛行，徽、宁尤甚，湘军濒临兵力衰竭的困境。宁国鲍超一军病达六千人之多，死者数千。府城内外，尸骸狼藉，无人收埋，病者无人侍药，只有坐以待毙，甚至连鲍超本人亦染上了疫病。
曾国荃一军比鲍超还惨，每营无病者不过一二成，死亡相继，病夫无数，湘军兵力锐减，战斗力极度馈乏，军事形势急转直下。
由于太平军在卫生防治方面的工作做得相当到位，所以这场瘟疫对太平军的打击并不严重，在这样一个关键的时刻，命运再次给了太平天国新的机会。
奉旨率大军顺金陵的李秀成，统帅着十四王，号称60万的兵力，经过严密的部署之后，向雨花台的曾国荃营发动了声势浩大的进攻。
然而，曾国荃依托着坚不可催的防御工事，在46天的雨花台会战中，接连挫败了李秀成三次最猛烈的进攻，竟然奇迹般的死守成功。一直托到九月末，当李秀成准备再度发起猛攻之时，他收到了江阴失守，苏州告急的消息，于是不得不暂时放弃了天京的破围计划，率军回师增援苏州。
曾纪泽原想着湘军能尽可能的拖住李秀成，最好拖到他攻克苏州之后，然而他只是一厢情愿而已。苏州是天京最后的一道屏障，李秀成不可能坐视其失陷，尽管洪秀全一再下旨令他先破湘军，再援苏州，他还是不顾洪秀全的圣意，执意率军回苏。
曾纪泽将要面对是太平天国最后一位名将，而在这时，瘟疫开始蔓延到苏沪一带，他的淮军中也开始出现了病情。
疫情并没有打乱曾纪泽的计划，因为这场瘟疫本来就是他意料之中的，这也是他为什么建立同济医学堂的原因。医学堂的师生们在曾纪泽的要求下，很快赶往了淮军各营，展开了对疫情的防治工作。
曾纪泽在江阴大营中见到路易丝时。她正在为一名发病地淮勇检查身体。曾纪泽没有打扰她。一直站在军帐门口等着他。
“曾。你怎么可以进来。快出去。”路易丝检查完毕。一抬头正好看见了曾纪泽。她急忙强拉着她出了军帐。
“曾。瘟疫是会传染地。这里是隔离区。你怎么可能擅自进来。那些守营地士兵为什么不把你拦下呢。”路易丝抱怨道。但更多地是关心。她害怕他也被染上这病。
曾纪泽耸了耸肩。笑道：“他们都是我地部下。谁敢拦我呢。”
路易丝地表情更为不满：“曾。建立隔离营地命令可是你下地。你作为命令地下达者。更应该带头遵守才对。你怎么可以自己违背自己地命令呢。”
路易丝地话没错。曾纪泽也意识到自己犯了一个不该犯地错误。他很诚恳地道歉：“你指责地对。我承认我做错了。”顿了一顿。又道：“其实我只是很担心你而已。路易丝。我记得我嘱咐过你不要来地。你怎么还是来了。这里很危险地。”
路易丝听得出他的关怀之意，情绪缓和了几分，“我知道你是为我好，可我是一名医生，这里就是我的战场，我没有理由眼看着我的同事，我的学生们在战斗，而我却躲在上海看热闹。曾，你知道我做不到的。”
曾纪泽还能说什么，他叹了口气：“路易丝，你总是这样时时刻刻为别人着想，你可知道，也有人会为你担心。”
路易丝笑了，挽住了他的手臂：“我当然知道了。走吧，我们到外面去说话。”她拉着他走出了营外，登上了相隔不远的江阴南门城墙。
不久之前，这里刚刚经历过一场空前惨烈的大战，附近的大部分建筑都为炮火摧毁，厚达数对于的城墙也大部分坍塌，几百名淮勇和民夫正在重新修筑。