万历三十五年年底，公元1608年的1月，耶稣会中国教区主教利玛窦的助手意大利传教士金尼阁,刚刚应徐光启的邀请来到南京传教的意大利神父郭居静，这两位中西文化交流史上的著名人物一起来到了泉州港
金尼阁，这是名，字四表，原名尼古拉?特里戈，1577年3月3日生于今法国的杜埃城，它位于佛兰德斯境内。佛兰德斯为西欧历史地名，金尼阁生活的时代处在西班牙统治下。人们按照古代居住在这里的比利时人部落称此地为“比利时”。金尼阁的故乡杜埃在其去世半个多世纪后被法国征服并划入法国版图，不过，其宗教生活的重要地点图尔内仍在比利时境内。因而自今日言，金尼阁被看作法国人固然也无不可，因此，法国人在研究中法交流史的时候，一般都毫不犹豫地把金尼阁当做第一个来华的法籍耶稣会士。
金尼阁1594年11月9日入耶稣会，本来要到1607年3月才全部完成了教会规定的学业。不过，由于耶稣会台湾教区在几年前成立后，巴拉达斯主教向耶稣会总部报告说急需人手，他就在1605年就被派赴远东传教，从葡萄牙的里斯本启程，1607年（万历三十五年）秋，经由肇庆抵达南京，开始了在中国的传教生涯。在南京金尼阁随高一志、郭居静两神甫学习，没过多久就传来了台湾巡检司禁教和封教堂的事，同时福建各地反对天主教的文人士绅也开始煽动禁教。
当时的南京，也有不少人对天主教表示出非常敌视的态度，如果不是徐光启这样的名流大宦在那里支持天主教，这些西洋修道士很可能早就被赶出南京了。
利玛窦忧心忡忡，不愿看到自己呕心沥血开创的传教事业，因为一个偏远海岛的禁教而受到损害。他对台湾并非一无所知，在朝廷、官府还无人注意到台湾的时候，他就已经因为《东西洋行记》一书对中华公司的起者尹峰注意上了，巴拉达斯、尤文辉都是奉他的命令来到台湾的。
这一次，他不明白台湾到底出了什么事，因此在北京出信件，请求金尼阁去台湾打听情况，有可能的话做一番斡旋工作，解决禁教问题。
金尼阁在原本的历史时空中，是最早的汉语拼音方案的明者，不过如今他才来中国，不熟悉情况，只好请求郭居静神父帮忙。两年前尹峰带人围攻澳门的时候，郭居静作为澳门市政当局的谈判使者，曾经和尹峰打过交道，他立刻答应了金尼阁的请求。
因此，两位传教士一齐出现在了泉州港。
泉州在元朝时期是天主教在华传教的重地，不过现在已经找不到一点天主教的影子了。明万历三年（1575年），西班牙人在马尼拉城下，帮助明朝打败了尹峰的先辈，海上枭雄林凤。天主教奥士定会士德?拉达大主教从马尼拉到达泉州，向福建官府邀功请赏，向兴泉道官尹要求允许居留和传教，但遭到拒绝，被赶走了事。历史似乎是在开玩笑，如今，尹峰的中华公司已经占领了菲律宾大部，牢牢控制了福建沿海。而耶稣会传教士金尼阁和郭居静，却是要从泉州出请求中华公司开禁传教。
此时，泉州城还有三百多名中华公司护卫队以衙役、团练的名义驻扎，协助泉州知府衙门管理着灾后的泉州城。港口的税务官吏早就被换做了中华公司派出的人员。他俩花了一大笔钱，才上了一条不属于中华公司的商船。船东是浙江商人，和福建巡抚有亲戚关系，因此才敢让两个西洋传教士上船。
船老大把两人领到最底层的货舱，对他们低声说道：“华兴联号的东主有严令，凡西洋传教士要搭船去台湾，哦，就是东番了，都必须去他们在各港口的分号报告备案。在到达台湾之前，你们最好不要出来。”
两位传教士互相看了看，无奈地点点头。
不过旅程出乎意料地顺利，他们顺风顺水地平安到了台湾港。
其实，尹峰并没有下令禁止西洋传教士进入台湾，实际上他只是命令要严格核查传教士的身份，不允许西班牙国籍的传教士入境。
那些在泉州办理港务事宜的中华公司职员确实知道西班牙人和其他国家人的区别，可一般百姓、普通的商人根本不知道这看起来都差不多的西洋大胡子之间还有国籍区别。因此，福建沿海就到处流传开了台湾港禁止西洋传教士入境的说法了。
金尼阁上岸之后，还是有点不相信自己的感觉。他好奇地对郭居静说：“尊敬的神父，这里的港务官员好像不收税啊？
郭居静笑了笑：“我们所在的港口是中华公司的，也就是本岛的实际统治者尹峰管辖的。他的商船队眼下是福建沿海，可能是中国沿海最大的。那些停泊在港口内的船只大多数属于中华公司，还有一些来自南洋、印度等地的，都有着中化公司的股份。所以，这里是自由港，干脆是不收入港税的。”