在吴绍霆的设计之下，共和国精英师才是中华民国的常规军部队。
经过《全**事整编计划定案》的规划，国防部拟定共和国精英师的二级编制皆为整编师，而则第一阶段之内的一级编制预计组建七个集团军。除了已经编成的近畿铁道集团军，以及正在编制中的南方第一集团军、北方第一集团军之外，还将设立中央集团军的番号。
会议上，吴绍霆直接下达命令，将原广东卫戍军整编为两个师，番号为共和国精英第五师、第六师，再加上广西五个师整编为两个师，番号为精英第七师、第八师，合编为南方第一集团军。代理总司令为陈炯明，总参谋长为李汉章，总司令部设于广州。
南方第一集团军除了辖下四个精英师，还将配备一个战略火炮旅、一个海岸巡防旅（包括一艘轻型巡洋舰和八艘鱼雷艇）、一个海军陆战旅（即参与杭州会战的福州海卫队），附加一个通讯团、一个后勤运输团、一个铁道防卫团。同时集团军司令部直辖虎门要塞、金门要塞以及福州要塞三座海防工事。全员编制七万八千人。
北方第一集团军由于政治因素，段时间内无法完成建制，只是在北京大本营虚留番号。
原南方联军第一师团改编为中央第二集团军，司令部设于长沙，莫擎宇为总司令，萧耀南为参谋长。
之前的广东三十七师、三十八师和三十九师原本就是大型师编制，现在直接更改番号为共和国精英师第一师、第二师、第三师。之前广东骑兵师与南方联军第五师合编为精英第四师，李济深为师长，梁鸿楷为副师长，蒋光鼐为师部参谋长，孙继直调任国防军任职。
中央第二集团军驻扎地为湖南全省、江西赣州、广东韶关以及贵州黔南等地，除了四个精英师之外还有附属的战斗旅、团若干，全军兵员七万两千人。
虽然中央第二集团军是吴绍霆的嫡系部队，可兵员组成反而是目前几个集团军中最少的，这是因为国防军编练过程中从这些部队中招募了不少现役士兵。
要说吴绍霆不愿意加强自己的嫡系部队那是假话，就目前中国地方军队而言，粤军的战斗力、装备、人员素质都是一流的。只可惜坏就坏在地域局限性，粤军常年在南方作战，兵员百分之九十都是南方人，一旦开到北方肯定会受不了水土环境，战斗力必然大打折扣。对此只能逐步改善士兵的适应能力，不能急于求成。
驻扎在武汉的南方联军第七师团改编为中央第三集团军，杨希闵、刘震寰、戴勘三个师加上收编的鄂军四个师，以及徐树铮新中央第十三师的旧部，另外还包括一部分川军、滇军，一起整编为六个精英师。番号为第十四、第十五、第十六、第十七、第十八和第十九师，防区为整个华中地区，并涉及河南、安徽部分地区，同时负责京汉线铁路的护卫工作。总司令任由回国归来的蔡锷担任，而韦汝聰则担任总参谋长。
中央第三集团军建成之后，其编制规模甚至会超过近畿铁道集团军，全兵力将会达到十一万人，是中华民国名副其实的第一大部队。
吴绍霆之所以允许中央第三集团军有如此大的规模，是因为他对这支部队寄予很大的期望，当年的南方七大师团除了广东部队之外，第七师团在蔡锷的领导之下可谓是最能打的一支，先后经过四川大战和湖北大战的洗礼，足以冠上劲旅的称谓。再者第七师团的兵员来自多个省，没有任何地域偏见，如今由融入了鄂军士兵，南北气候环境适应力更快。
就防守而言，湖北是衔接东南西北的交通要地，自然需要一支重装部队驻守。而在出兵进攻的设想上，吴绍霆甚至打算由中央第三集团军完成北京大本营的坐镇，直接威胁东三省的日本关东驻军。